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第17期小班:复杂网络、SVM、GCA、FNC、CAT12以及Dynamic

发布:2021-02-23    浏览:66 次


第17期小班:复杂网络、SVM、GCA、FNC、CAT12以及Dynamic



2021.03.30-2021.04.04(周二~周日)

主办单位:杭州脑海科技有限公司

协办单位:杭州师范大学心理科学研究院


1. 内容概括


1) 本期培训班在杭州举办为期6天(03月30日-04月04日)

2) 内容涵盖:

  • 脑功能网络构建及结构网络构建

  • 基于图论的脑网络拓扑指标

  • ICA以及FNC的计算与统计

  • 格兰杰因果分析(GCA

  • 支持向量机(SVM

  • 静态指标及动态指标计算(Dynamic

  • 基于体素的形态学分析(CAT12

  • T检验以及方差分析

  • 参数检验、置换检验等统计方法

  • 结果呈现(作图、做表)


对多模态MRI课程感兴趣的朋友可以参加第16期课程,覆盖:任务态、静息态、DTI以及VBM等技术

03月23日-03月28日,第16期:多模态磁共振数据分析手把手基础班(点击此处查看详情)


2. 课程说明


大脑是一个在结构上和功能上都存在广泛相互连接的复杂网络,为了更清楚地揭示脑的工作机理,功能磁共振成像近年来凭借其非侵入性、无辐射的优势被广泛应用于脑科学的研究中。
目前,神经科学家们充分认识到了构建人脑网络的重要性,并正式提出人脑连接组的概念,以期唤起不同领域的广大科研工作者对该问题的重视。复杂网络理论目前已被应用于神经科学的相关研究中。探究大脑网络的基本属性以及脑区间潜在的拓扑关系为窥探大脑内部的神经活动规律以及各种神经精神疾病的发病机理等重大神经科学问题提供全新的视角。另外,脑功能网络间的空间独立成分分析可以实现静息态脑功能模块空间模式和对应时间特征信号分离,揭示了脑功能模块之间加工过程的信息转换和整合关系。
为了帮助大家更快速地掌握脑网络及相关的数据分析方法,我们拟举办一期专门针对脑网络的数据分析培训班,内容涵盖:脑功能网络构建及结构网络构建、基于图论的脑网络拓扑指标、基于空间独立成分分析的网络内和网络间功能连接分析、格兰杰因果分析、支持向量机、Dynamic指标、基于体素的形态学分析等。此外,课程内容还添加了参数检验、置换检验等统计方法。
本课程为期6天,为确保大家在6天内可以充分的掌握内容,我们承诺:每期都会根据学员人数安排充足的助教,保证手把手指导分析数据注:脑海科技团队一共拥有10余人的助教)。希望协助刚刚接触磁共振成像的科研工作者快速掌握功能磁共振的数据分析原理以及方法,以便能够应用到相关的研究领域中。本次培训面向神经内科、精神科(心理科)、放射科、康复科、消化科、儿科等科室的临床医生,以及各大高校从事脑科学研究的生物医学工程、计算机、数学等专业的研究人员。本次培训班兼具原理与操作,相信6天的学习定会对学员有所助益。
注:请提前一天到会场202103月29(13:30 - 20:00)安装软件、熟悉场地、拷贝资料等。

3. 课程安排

周二

3

30

上午

贾熙泽

臧玉峰
课程总论以及重要概念介绍
静息态功能磁共振概述及其在认知与脑疾病的应用前景

下午

贾熙泽
功能磁共振数据分析概论
功能磁共振数据采集常见错误
功能磁共振数据整理常见问题


晚上

张韬
功能磁共振软件安装与常见问题
功能磁共振数据格式转换
数据整理及归类

3

31

上午

贾熙泽
静息态数据预处理原理
静息态数据预处理注意事项
静息态数据预处理常见错误分析

下午

张韬
基于体素的形态学的原理与应用
横向数据以及纵向数据的形态学分析方法
CAT12软件的应用介绍以及形态学指标的计算
基于体素的形态学分析的统计方法介绍与实操

晚上

张韬
独立成分分析(ICA)原理介绍
ICASSO介绍
GIFT上机实操

4

1

上午

袁丽霞
FNC的分析原理介绍
FNC在脑疾病中的应用举例

下午

袁丽霞
FNC的计算步骤详解
FNC的网络构建及统计分析
FNC的结果呈现

晚上

孙家伟
GCA概念和原理介绍
Blind deconvolution原理推导和实操
GCA实操和结果呈现

4

2

上午

曹淼
脑连接组学简介
基于图论的复杂网络拓扑指标在临床中的应用

下午

曹淼
基于静息态fMRI的脑功能网络构建方法
基于sMRI的脑结构网络构建方法
采用Gretna构建脑网络

晚上

张韬
Dynamic指标原理
Dynamic指标实操

4

3

上午

曹淼
基于图论的脑网络拓扑指标计定义与计算方法
基于Gretna计算脑网络拓扑指标

下午

曹淼
脑网络拓扑指标的统计分析介绍
脑网络拓扑指标的统计分析实操:参数检验、置换检验等、NBS

晚上

孙家伟
支持向量机(SVM)概念介绍及使用情境
SVM中的核技巧及常用核函数的讲解
三种常用交叉验证方法的讲解(简单交叉验证,K‍‍折交叉验证,留一交叉验证)
基于Grid Search(网格搜索)的SVM参数调优

4

4

上午

张韬
单样本T检验、样本T检验、配对样本T检验
多重比较校正介绍
FDRFWEGRFAlphaSimTFCE介绍与实操

下午

张韬
单因素方差分析(多组)
单因素方差分析(重复测量)
双因素方差分析
结果呈现与表格制作
BrainNet作图



备注:请各位学员自带笔记本电脑,建议电脑配置:windows 64位系统、8G以上内存、80G以上剩余硬盘空间。请尽量携带Windows电脑,如果只能使用苹果MAC电脑,请提前使用Bootcmap安装windows 64位系统


4. 授课老师


臧玉峰:医学博士。杭州师范大学心理科学研究院执行院长。1984年于河北医学院获医学学士学位、1991年于天津医学院获神经外科学硕士学位、2002年于北京大学精神卫生研究所获儿童精神卫生博士学位。曾经从事临床神经外科工作14年,之后在中科院自动化所模式识别国家重点实验室、北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室以及杭州师范大学工作。近年来主要从事静息态功能磁共振影像的计算方法学及其在认知与脑疾病的应用研究。与同事提出“局部一致性”和“低频振幅”等方法。带领研究团队开发了REST、DPARSF、RESTplus等软件。合作发表英语论文100多篇,Google Scholar数据库引用21319次(h指数64)。2014到2018年连续5年入选Elsevier“中国高被引学者”(神经科学),2017、2018年入选Clarivate 高被引学者(神经与行为科学)。


曹淼:复旦大学类脑智能科学与技术研究院青年研究员,主要研究方向为多模态磁共振脑影像计算方法,脑连接组学,脑发育和语言功能发展。获得“国家自然基金青年项目”、上海市自然科学基金面上项目、上海市“脑与类脑智能基础转化应用研究”重大科技专项子课题等研究资助。发表SCI论文15篇,其中以第一作者在Trends in Neuroscience,Cerebral Cortex 等期刊发表论文 8 篇,影响因子 5 以上的 4 篇,论文被 Nature Reviews Neuroscience, Trends in Cognitive Sciences, Nature Communications, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 等国际顶尖期刊多次正面引用。


袁丽霞:毕业于浙江大学生物医学工程专业,获工学博士学位,现为杭州师范大学助理研究员。博士前期师从杜一平老师学习磁共振物理、序列设计和数据分析,后期跟随臧玉峰老师学习功能磁共振,并探索适用于功能磁共振的数据分析方法。目前主要的研究方向是多回波功能磁共振数据分析。曾以第一作者发表SCI文章2篇。


贾熙泽:杭州脑海科技有限公司首席执行官,杭州师范大学助理研究员,中国心理学会积极心理学专委会委员,具有计算机、心理学及神经科学交叉背景。目前主持国自然青年基金项目1项,并作为主要参与人参与多项国自然科学基金项目。主要研究方向为静息态功能磁共振方法学、脑影像Meta分析以及静息态数据分析软件开发。2013年起负责维护REST系列工具包,并开发了RESTplus,该软件的论文目前已发表于Science Bulletin (影响因子9.5分)。静息态功能磁共振论坛(http://www.restfmri.net)管理员。合作发表SCI文章19篇,其中主要作者9篇(第一作者或通讯作者)。Frontiers in Neuroscience(SCI医学2区,3年平均IF 3.69)、Frontiers in Psychology(SSCI心理学2区期刊,影响因子2.0)以及Frontiers in Psychiatry(SCI医学3区,3年平均IF 3.18)杂志的评审编辑,Journal of Magnetic Resonance Imaging、Frontiers Aging Neuroscience、Neural Plasticity、Scientific Report等多个杂志的审稿人,曾多次受邀在国内外重要学术会议介绍静息态磁共振数据分析。


张韬:脑海科技高级数据分析工程师


5. 培训说明


培训班限额招生20人。我们会按照缴费顺序安排座位,为方便会务安排,报名敬请从速。考虑到疫情原因,本次培训每名学员每天发1个口罩。学员需要提供杭州健康码(支付宝首页搜索‘杭州健康码’)。

6. 培训费用


费用包括培训费、资料费、培训期间提供快餐、饮品以及点心,交通及住宿费用自理,每人3500元。本培训班开具可以报销的正式发票。可以现场刷公务卡,培训期间谢绝录像及录音。可以银行卡转账或支付宝付款,支付宝账号:19941364880,杨会云

7. 培训地点


培训地点:浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼10楼,脑海科技第3会议室。

8. 报名方式


请将报名回执以及缴费回执发送至srbrain@126.com,我们会联系您。

9. 联系方式


电话咨询:黄国峰 180 7298 0399

微信咨询:黄国峰 180 7298 0399


报名回执表

单位名称(发票抬头,纳税人识别号)


发票类型(会议费/培训费)


姓名


性别


电话号码


微信


科室/专业


研究方向


银行信息

户名:杭州脑海科技有限公司

账号:3301040160015883146

开户行:杭州银行萧山支行

汇款备注

第17期小班

10. 在线支持服务


脑海科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持以及合作服务,确保学员能够熟练掌握脑影像数据处理的相关方法。


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2. 使用百度网盘下载:

链接:https://pan.baidu.com/s/18Pm5HoY2gDTamo7OK-hJMQ

提取码:nhkj


3. 请加微信:180 7298 0399 获取word文档。


其他培训班:

03月23日-03月28日,第16期:多模态磁共振数据分析手把手基础班(点击此处查看详情)

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