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西门子、飞利浦、联影、GE…发布:2021-05-24 浏览:346 次
第24期小班:复杂网络相关指标理论及实操专题培训
2021.07.20-2021.07.25(周二~周日)
主办单位:杭州脑海科技有限公司
协办单位:杭州师范大学心理科学研究院
杭州拾睿科技有限公司
1. 内容概括
1) 本期培训班在杭州举办为期6天(7月20日-7月25日)
2) 重点内容(详细内容见课表):
脑功能网络构建及灰质形态协变网络构建
基于图论的脑网络拓扑指标理论及实操(Gretna、BrainNet)
基于Python的复杂网络分析(nibabel、nilearn、bctpy、stasmodels、brainspace)
脑网络论文审稿常见问题
基于体素的形态学分析(CAT12)
一般线性模型介绍及SPM二阶分析及多重比较校正(FWE,FDR,GRF,Alphasim,TFCE)
SnPM以及ANOVA
等等
2. 课程说明
3. 课程安排
07月 20日 周二 第1天 臧玉峰 贾熙泽 张韬 | 上午 | 静息态概论与课程介绍 | 静息态功能磁共振概述及其在认知与脑疾病的应用前景 |
课程体系介绍 | |||
下午 | 数据采集注意事项 | 静息态功能磁共振实验设计注意事项 | |
静息态数据采集注意事项 | |||
关于多重比较校正 | |||
晚上 | 数据预处理 | 静息态数据预处理理论 | |
静息态数预处理操作 | |||
07月 21日 周三 第2天 张韬 李仔麒 | 上午 | 基于体素的形态学分析 | 基于体素的形态学分析:原理及应用 |
横向数据以及纵向数据的形态学分析方法 | |||
CAT12软件应用及形态学指标计算 | |||
形态学指标与临床指标的相关性分析 | |||
下午 | 基于体素的统计分析及结果呈现 | 一般线性模型介绍 | |
SPM的二阶分析(T检验) | |||
多重比较校正(FWE,FDR,GRF,Alphasim,TFCE) | |||
图表制作(RESTplus Viewer,MRIcron) | |||
晚上 | PYTHON入门与实操 | PYTHON环境配置与安装 | |
PYTHON基础语法 | |||
PYTHON上机实操与练习 | |||
07月 22日 周四 第3天 夏明睿 张韬 | 上午 | 图论概述及基础知识 | 神经影像与人脑连接组学:发展与展望 |
基于图论的复杂网络基础知识 | |||
下午 | 脑功能网络及灰质形态协变网络构建等 | 脑功能网络和灰质形态协变网络构建方法 | |
脑连接组分析软件Gretna计算部分 | |||
晚上 | 实操复习 | 自由练习与问题答疑 | |
实操带练复习课 | |||
07月 23日 周五 第4天 夏明睿 张韬 | 上午 | 脑连接组学应用研究及拓扑指标统计方法 | 脑连接组学计算方法及应用研究 |
脑网络拓扑指标的统计方法 | |||
下午 | 统计实操、作图简介及脑网络论文审稿常见问题 | 脑连接组分析软件Gretna统计部分介绍 | |
脑连接组可视化软件BrainNet Viewer简介 | |||
脑网络论文审稿常见问题 | |||
晚上 | 脑连接组可视化软件实操及复习课 | 脑网络可视化软件BrainNet Viewer介绍 | |
Brain network的可视化 | |||
Statistical volume file的可视化 | |||
BrainNet Viewer其它的可视化功能 | |||
自由练习与问题答疑 | |||
实操带练复习课 | |||
07月 24日 周六 第5天 张翼 李仔麒 | 上午 | 基于PYTHON语言的复杂网络分析 | 静息态功能网络的构建流程 |
静息态功能网络中的常用度量 | |||
静息态功能网络中的降维——主成分分析(PCA) | |||
下午 | 使用nibabel与nilearn构建网络 | ||
使用bctpy计算网络度量 | |||
使用statsmodels进行统计检验 | |||
使用brainspace与nilearn进行可视化 | |||
晚上 | 白天内容复习与答疑 | 自由练习与问题答疑 | |
实操带练复习课 | |||
07月 25日 周日 第6天 张韬 | 上午 | SnPM介绍与实操 | 非参数统计基本概念 |
非参数统计理论介绍 | |||
基于SnPM的统计方 | |||
下午 | 方差分析理论与实操 | 方差分析介绍 | |
单因素方差分析(between subject & within subject) | |||
2*2设计的双因素方差分析 | |||
双因素混合设计的方差分析 |
备注:请各位学员自带笔记本电脑,建议电脑配置:windows 64位系统、8G以上内存、80G以上剩余硬盘空间。请尽量携带Windows电脑,如果只能使用苹果MAC电脑,请提前使用Bootcmap安装windows 64位系统。
4. 讲师简介
臧玉峰:医学博士,杭州师范大学心理科学研究院执行院长,杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心主任,浙江省认知障碍评估技术研究重点实验室主任。1984年于河北医学院获医学学士学位、1991年于天津医学院获神经外科学硕士学位(导师薛庆澄教授)、2002年于北京大学精神卫生研究所获精神病学博士学位(导师王玉凤教授)。曾经从事临床神经外科工作14年,2002年至今先后在中科院自动化所模式识别国家重点实验室、北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室以及杭州师范大学工作。主要从事静息态功能磁共振计算方法及其在认知与脑疾病的应用研究。提出“局一致性”和“低频振幅”等方法。带领研究团队开发了REST、DPARSF、REST-GCA、RESTplus等软件。合作发表论文100多篇,被引用>28,000次(谷歌学术),有5篇主要作者论文被引用1116-2366次。共同领导多个国际多中心静息态功能磁共振合作研究。2014到2020年连续7年入选Elsevier“中国高被引学者”(神经科学、心理学),2017、2018年入选Clarivate 高被引学者(神经与行为科学)。
夏明睿:北京师范大学心理学部副教授、博导。从事脑影像连接组大数据计算方法及其在神经精神疾病中的应用研究。主持国家自然科学基金面上、青年项目3项,入选北京市科技新星计划,国自然创新研究群体成员,参加国家自然科学基金重大研究计划、科技部863、北京市脑计划等10余项国家和省部级课题。在本领域发表SCI论文53篇,其中以第一/通讯作者在Schizophr Bull、Neuroimage等发表论文25篇,6篇入选ESI top 1%高被引论文,Google总引用5000余次。研发的神经影像连接组可视化软件被哈佛大学、牛津大学等1200多个国内外实验室采用。担任中国心理学会心理学脑成像专业委员会秘书长、委员,中国认知科学学会神经与精神影像专业委员会委员;国家自然科学基金、英国BBSRC基金评审专家;Front Neurosci、Front Hum Neurosci等期刊编委,Neurosci Biobehav Rev、IEEE Trans Med Imaging、Neuroimage、Hum Brain Mapp等四十余个SCI期刊审稿人。入选Elsevier 2020年度中国高被引学者(心理学领域)。
张翼:博士生,目前在浙江大学物理学系交叉学科实验室学习,师从唐孝威院士。主要关注长期认知训练对脑的塑造作用,可熟练使用python语言分析功能磁共振数据,尤其擅长对静息态功能网络有关问题的分析。以第一作者发表SCI论文1篇(Cerebral Cortex),SSCI论文1篇(Consciousness and Cognition)。
贾熙泽:杭州脑海科技有限公司首席执行官,杭州师范大学助理研究员,中国心理学会积极心理学专委会委员,具有计算机、心理学及神经科学交叉背景。目前主持国自然青年基金项目1项,并作为主要参与人参与多项国自然科学基金项目。主要研究方向为静息态功能磁共振方法学、脑影像Meta分析以及静息态数据分析软件开发。2013年起负责维护REST系列工具包,并开发了RESTplus,该软件的论文目前已发表于Science Bulletin (影响因子9.5分)。静息态功能磁共振论坛(http://www.restfmri.net)管理员。合作发表SCI文章21篇,其中主要作者11篇(第一作者或通讯作者)。Neural Plasticity杂志的guest editor,Frontiers in Neuroscience(SCI医学2区,3年平均 IF 3.69)、Frontiers in Psychology(SSCI心理学2区期刊,影响因子2.0)以及Frontiers in Psychiatry(SCI医学3区,3年平均IF 3.18)杂志的评审编辑,Journal of Magnetic Resonance Imaging、Frontiers Aging Neuroscience、Brain research、Scientific Report等多个杂志的审稿人,曾多次受邀在国内外重要学术会议介绍静息态磁共振数据分析。
张韬:脑海科技高级数据分析工程师
李仔麒:脑海科技高级数据分析工程师
5. 培训说明
培训班限额招生20人,报满截止。我们会按照缴费顺序安排座位,为方便会务安排,报名敬请从速。考虑到疫情原因,本次培训每名学员每天发1个口罩。学员需要提供杭州健康码(支付宝首页搜索‘杭州健康码’)。
6. 培训费用
7. 培训地点
8. 报名方式
9. 联系方式
电话咨询:黄国峰 180 7298 0399
微信咨询:黄国峰 180 7298 0399
报名回执表
单位名称(发票抬头) | |
纳税人识别号(税号) | |
发票类型(会议费/培训费) | |
姓名 | |
性别 | |
电话号码 | |
微信 | |
科室/专业 | |
研究方向 | |
银行信息 | 户名:杭州脑海科技有限公司 账号:3301040160015883146 开户行:杭州银行萧山支行 |
汇款备注 | 第24期小班 |
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