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第26期:多模态磁共振数据分析手把手基础班

发布:2021-05-28    浏览:72 次


第26期:多模态磁共振数据分析手把手基础班



2021.08.03-2021.08.08(周二~周日)

主办单位:杭州脑海科技有限公司

协办单位:杭州师范大学心理科学研究院

                 杭州拾睿科技有限公司


1. 特色如下


1)课程时间充足,在杭州为期6天的系统培训(08月03日-08月08日)

2)通过合理的课程设计,为学员后续多模态数据分析打下坚实基础,内容涵盖:

  • AFNI,GLM方法介绍和实操

  • MVPA原理及分析流程

  • SVM,LDA,RSA及Searchlight方法的原理及实操

  • AFNI组分析方法介绍和实操

  • 格兰杰因果分析(GCA)原理及操作

  • 独立成分分析(ICA)

  • 局部指标计算(如:ALFF、fALFF、PerAF、ReHo等)

  • FCD、FCS、Functional connectivity等指标计算

  • FA、MD、AD、RD指标计算

  • TBSS原理及分析实操

3)  基础课程设置合理扎实,内容包含:
   A. 磁共振实验设计及数据采集注意事项
   BMRI数据分析指标在文章中的应用及常见问题
   C. 基于坐标的Meta分析(ALE)
   D. 统计分析(1):T检验、ANOVA
   E统计分析(2):多重比较校正原理及操作(FWE、FDR、GRF、AlphaSim以及TFCE等)
   F. 多模态数据分析结果呈现(图以及表的制作)

2. 课程说明


近年来随着技术的不断发展,脑科学引起越来越多研究者的兴趣。目前磁共振已逐渐被广泛应用于神经、精神、消化、认知等医学和心理学领域,用于探索大脑发育、老化、情绪加工、运动障碍及记忆巩固等机制。掌握磁共振数据处理技术变得越来越重要。

本次课程内容相对基础,几乎涵盖了所有适合初学者掌握的技术,课程内容覆盖多模态技术,包括:任务态、静息态、结构像(形态学分析及DTI)。对于已有数据的学员可以快速上手多模态数据分析,对于没有数据的学员也可以尝试Meta分析。
本课程为期6天,课程设计环环相扣,为确保大家在6天内可以充分的掌握内容,我们承诺:每期都会根据学员人数安排充足的助教,保证手把手指导分析数据注:脑海科技团队一共拥有10余人的助教。确保急需掌握数据分析的临床医生以及科研工作者在6天快速掌握需要的数据分析技术。希望我们的培训班可以最大程度的满足零基础学员的快速掌握数据分析重要原理及相应技术的需求。
注:请提前一天到会场2021年08月02日(13:30 - 20:00)安装软件、熟悉场地、拷贝资料等。

3. 课程安排

第1天

8.3

周二


贾熙泽
张韬

[上午]

基础概念、课程体系及数据初识

9:00 - 12:00

功能磁共振基本概念介绍

课程体系介绍

功能磁共振数据初识

张韬

[下午]

软件安装、数据整理及与预处理原理

14:00 -17:00

功能磁共振软件安装

功能磁共振数据整理实操

静息态数据预处理原理介绍

张韬
黄国峰

[晚上]

预处理实操及Linux入门

18:00 - 21:30

静息态数据预处理实操及常见报错解析

任务态数据预处理与静息态区

Linux入门

第2天

8.4

周三


戴睿

[上午]

任务态激活分析及组分析方法介绍

9:00 - 12:00

AFNI GLM方法介绍和实操

AFNI个体GLM结果查看

AFNI 批处理GLM分析

AFNI组分析方法介绍和实操

戴睿

[下午]

任务态结果校正及结果显示

14:00 -17:00

AFNI多重比较矫正方法介绍和实操

AFNI和SUMA联动查看和展示结果

AFNI感兴趣区分析方法介绍和实操

张韬

[晚上]

静息态指标分析

18:00 - 21:30

ALFF、fALFF以及PerAF指标原理及实

ReHo原理及实操

基于种子点功能连接原理介绍

FCD、FCS原理及实操

第3天

8.5

周四


戴睿

[上午]

MVPA原理及分析流程

9:00 - 12:00

MVPA原理简介

MVPA分析流程

SVM方法的原理与实操

戴睿

[下午]

LDA,RSA及Searchlight方法的原理及实操

14:00 -17:00

LDA方法的原理与实操

RSA方法的原理和实操

Searchlight方法的原理和实操

张韬

[晚上]

统计分析

18:00 - 21:30

统计检验理论+实操

多重比较校正介绍

FDR、FWE原理及实操

GRF、AlphaSim原理及实操

第4天

8.6

周五

张韬

[上午]

DTI数据分析入门

9:00 - 12:00

DTI基础原理

DTI数据分析操作基本流程及FSL初步使用

FA、MD、AD、RD指标计算

张韬

[下午]

DTI数据分析进阶

14:00 -17:00

TBSS数据分析原理介绍

TBSS数据分析步骤解读及实操

DTI数据分析结果呈现

DTI数据分析结果的统计分析

孙家伟

[晚上]

ICA分析

18:00 - 21:30

独立成分分析(ICA)原理介绍

基于GIFT的ICA实操及参数讲解

ICA应用实例分析

ICA成分图绘制

第5天

8.7

周六


孙家伟

[上午]

格兰杰因果分析(GCA)

9:00 - 12:00

GCA概念和原理介绍

Blind deconvolution原理推导和实操

GCA实操和结果呈现

张韬

[下午]

结果汇报及常用工具

14:00 -17:00

REST Viewer的使用及作图注意事项

表格制作及脑区汇报注意事项

BrainNet:基于皮层的脑图制作

脑影像数据与临床指标的相关分析

实用小工具及相关使用

张韬

[晚上]

复习总结课

18:00 - 21:30

功能像数据分析复习与总结

结构像数据分析复习与总结

答疑与练习

第6天

8.8

周日




臧玉峰
贾熙泽

[上午]

研讨会及Meta分析

9:00 - 12:00

静息态功能磁共振概述及其在认知与脑疾病的应用前景

脑影像Meta分析介绍

ALE算法原理及操作解读

贾熙泽

[下午]

文章撰写的注意事项

14:00 -17:00

磁共振实验设计及数据采集注意事项

据分析指标在文章中的解释及常见问题

范文解读及文章撰写常见注意事项



备注:请各位学员自带笔记本电脑,建议电脑配置:windows 64位系统、8G以上内存、80G以上剩余硬盘空间。请尽量携带Windows电脑,如果只能使用苹果MAC电脑,请提前使用Bootcmap安装windows 64位系统


4. 授课教师


臧玉峰:医学博士。杭州师范大学心理科学研究院执行院长。1984年于河北医学院获医学学士学位、1991年于天津医学院获神经外科学硕士学位、2002年于北京大学精神卫生研究所获儿童精神卫生博士学位。曾经从事临床神经外科工作14年,之后在中科院自动化所模式识别国家重点实验室、北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室以及杭州师范大学工作。近年来主要从事静息态功能磁共振影像的计算方法学及其在认知与脑疾病的应用研究。与同事提出“局部一致性”和“低频振幅”等方法。带领研究团队开发了REST、DPARSF、RESTplus等软件。合作发表英语论文100多篇,Google Scholar数据库引用21319次(h指数64)。2014到2018年连续5年入选Elsevier“中国高被引学者”(神经科学),2017、2018年入选Clarivate 高被引学者(神经与行为科学)。


戴睿:中国科学院生物物理研究所脑与认知国家重点实验室博士后。研究方向是采用功能磁共振技术研究人类大脑面孔和文字等物体识别的神经机制。擅长采用多体素模式分析方法揭示大脑的信息表征本质。现主持国家自然科学基金和博士后基金各一项,发表多篇SCI论文,并担任Cerebral Cortex, Human Brain Mapping, Neuroimage, Cortex和心理科学进展等多个杂志的审稿人。


贾熙泽:杭州脑海科技有限公司首席执行官,杭州师范大学助理研究员,中国心理学会积极心理学专委会委员,具有计算机、心理学及神经科学交叉背景。目前主持国自然青年基金项目1项,并作为主要参与人参与多项国自然科学基金项目。主要研究方向为静息态功能磁共振方法学、脑影像Meta分析以及静息态数据分析软件开发。2013年起负责维护REST系列工具包,并开发了RESTplus,该软件的论文目前已发表于Science Bulletin (影响因子9.5分)。静息态功能磁共振论坛(http://www.restfmri.net)管理员。合作发表SCI文章21篇,其中主要作者11篇(第一作者或通讯作者)。Neural Plasticity杂志的guest editor,Frontiers in Neuroscience(SCI医学2区,3年平均 IF 3.69)、Frontiers in Psychology(SSCI心理学2区期刊,影响因子2.0)以及Frontiers in Psychiatry(SCI医学3区,3年平均IF 3.18)杂志的评审编辑,Journal of Magnetic Resonance Imaging、Frontiers Aging Neuroscience、Brain research、Scientific Report等多个杂志的审稿人,曾多次受邀在国内外重要学术会议介绍静息态磁共振数据分析。

 

张韬:脑海科技高级数据分析工程师

 

黄国峰:脑海科技高级数据分析工程师



5. 培训说明


培训班限额招生20人,报满截止。我们会按照缴费顺序安排座位,为方便会务安排,报名敬请从速。考虑到疫情原因,本次培训每名学员每天发1个口罩。学员需要提供杭州健康码(支付宝首页搜索‘杭州健康码’)。


6. 培训费用


费用包括培训费、资料费、培训期间提供快餐、饮品以及点心,交通及住宿费用自理,每人3500元。本培训班开具可以报销的正式发票。可以现场刷公务卡,培训期间谢绝录像。可以银行卡转账或支付宝付款,支付宝账号:19941364880,杨会云

7. 培训地点


培训地点:浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼10楼,脑海科技第3会议室。

8. 报名方式


请将报名回执以及缴费回执发送至srbrain@126.com,我们会联系您。

9. 联系方式


电话咨询:黄国峰 180 7298 0399

微信咨询:黄国峰 180 7298 0399


报名回执表

单位名称(发票抬头)


纳税人识别号(税号)


发票类型(会议费/培训费)


姓名


性别


电话号码


微信


科室/专业


研究方向


银行信息

户名:杭州脑海科技有限公司

账号:3301040160015883146

开户行:杭州银行萧山支行

汇款备注

               第26期小班

10. 在线支持服务


脑海科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持以及合作服务,确保学员能够熟练掌握脑影像数据处理的相关方法。


获取word版本


1. 扫描二维码

2. 使用百度网盘下载:

链接:https://pan.baidu.com/s/14kUtX14b4NljsxJZfCANaw

提取码:nhkj


3. 请加微信:180 7298 0399 索取word文档。


多模态基础班:

06月01日-06月06日,第21期小班:多模态磁共振数据分析手把手基础班(点击此处查看详情)

06月22日-06月27日,第22期小班:多模态磁共振数据分析手把手基础班(点击此处查看详情)


复杂网络专题培训:

07月20日-07月25日,第24期小班:复杂网络相关指标理论及实操专题培训(点击此处查看详情)


脑结构数据分析-Freesurfer专题培训:

7月27日-8月01日,第25期小班:脑结构数据分析-Freesurfer专题培训(点击此处查看详情)


弥散张量成像专题培训,内容涵盖,DTI、DKI、TBSS、确定性追踪、概率性追踪、基于白质纤维的网络构建等:

08月24日-08月29日,第28期小班:弥散张量成像(DTI)指标及纤维追踪专题培训(点击此处查看详情)



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