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第02期:使用格兰杰因果模型揭示人脑连接方向-基础训练营

发布:2021-10-02    浏览:93 次


第02期:使用格兰杰因果模型揭示人脑连接方向-基础训练营


2021.11.24-2021.11.28(周三~周日)

主办单位:杭州脑海科技有限公司

协办单位:杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心

                杭州拾睿科技有限公司


1. 课程说明


近年来,功能磁共振成像凭借其非侵入性、无辐射的优势被广泛应用于脑科学的研究中,来揭示脑的工作机理。
目前,神经科学家们充分认识到了脑区之间相互连接关系能够为我们探究脑异常活动、发育以及老化提供重要信息。虽然传统的无方向性功能连接方法提高了我们对大脑功能结构以及功能的理解,但是信息在大脑中传递的方向和模式仍不清楚。庆幸的是,格兰杰因果分析(Granger causality analysis, GCA)通过研究大脑脑区或网络之间连接的方向性,为脑信息传播方向的探究提供了重要途径,因而有助于我们从定向连接的角度理解功能性大脑结构。
为了帮助大家更快速地掌握脑网络及相关的数据分析方法,我们拟举办一期专门针对有向连接的数据分析培训班,内容涵盖各种有向连接的重要技术:格兰杰因果分析(GCA)、功能网络的有向连接、Dynamic GCA等此外,课程内容还添加了适用于有向连接的统计分析方法。
本课程为期5天,为确保大家在5天内可以充分的掌握内容,我们承诺:每期都会根据学员人数安排充足的助教,保证手把手指导分析数据(注:脑海科技团队一共拥有10余人的助教)。希望协助刚刚接触磁共振成像的科研工作者快速掌握功能磁共振的数据分析原理以及方法,以便能够应用到相关的研究领域中。本次培训面向神经内科、精神科(心理科)、放射科、康复科、消化科、儿科等科室的临床医生,以及各大高校从事脑科学研究的生物医学工程、计算机、数学等专业的研究人员。本次培训班兼具原理与操作,相信5天的学习定会对学员有所助益。
 
注:请提前一天到会场2021年11月23日(13:30 - 20:00)安装软件、熟悉场地、拷贝资料等。

2. 课程安排

第1天
周三
11.24

[上午]

GCA概念和原理介绍


9:00-12:00

基于系数和基于残差的GCA

GCA预处理步骤与实操

GCA实操

[下午]

GCA实操,结果呈现和文章解读


14:00-17:00

作表与BrainNet作图

GCA文章解读及写作思路介绍



[晚上]
复习
18:00-21:00
复习白天内容
第2天
周四
11.25



[上午]

GCA简介以及Blind Deconvolution


9:00-12:00

GCA概念和原理介绍

Blind deconvolution原理推导

Blind deconvolution实操

[下午]

GCA分析


14:00-17:00

GCA原理推导

GCA之voxel-wise分析

GCA之ROI-wise分析

GCA结果汇报及展示

[晚上]
复习
18:00-21:00
复习白天内容
第3天
周五
11.26


[上午]

白质功能网络构建原理简介


9:00-12:00

白质功能网络预处理流程介绍

组水平的白质Mask的制作

Kmeans聚类方法简介

[下午]

白质功能网络GCA分析实操及结果呈现


14:00-17:00

白质功能网络预处理实操

利用聚类构建功能网络

GCA的计算及统计分析

[晚上]
复习
18:00-21:00
复习白天内容
第4天
周六
11.27






[上午]

静息态技术与确定性DCM


9:00-12:00

静息态功能磁共振相关技术及文章撰写注意事项

DCM方法的基本原理

确定性DCM



[下午]

随机DCM及组分析


14:00-17:00

确定性DCM实操

随机DCM

随机DCM实操

组分析原理介绍



[晚上]
复习
18:00-21:00

组分析实操

复习白天内容
第5天
周日
11.28

[上午]

dynamic


9:00-12:00

dynamic概述

dynamic常用分析讲解

dynamic分析实操

[下午]

dynamic GCA


14:00-17:00

dGCA分析实操

dGCA聚类分析

dGCA统计分析

dGCA结果解读



备注:请各位学员自带笔记本电脑,建议电脑配置:windows 64位系统、8G以上内存、80G以上剩余硬盘空间。请尽量携带Windows电脑,如果只能使用苹果MAC电脑,请提前使用Bootcmap安装windows 64位系统


3. 授课教师



贾熙泽:杭州脑海科技有限公司首席执行官,杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心副研究员(兼职)。研究兴趣为:静息态方法学、基于脑影像的Meta分析以及脑影像技术在积极心理学中的应用。现任中国心理学会积极心理学专委会委员,师从任俊教授从事积极心理学研究。具有计算机、心理学及神经科学交叉背景。目前主持国自然青年基金项目1项,并作为主要参与人参与8项国自然科学基金项目。在臧玉峰教授的指导下,基于REST开发了RESTplus工具包,有关该工具包的论文于2019年发表于Science Bulletin(影响因子 9.5分,30次引用)。同时还担任静息态功能磁共振论坛网站(restfmri.net)的管理员。合作发表SCI文章23篇,主要作者13篇(第一作者或通讯作者)。Neural Plasticity杂志的guest editor、Frontiers in Neuroscience(SCI医学2区,3年平均IF 3.69)、Frontiers inPsychology(SSCI心理学2区期刊,影响因子2.0)以及Frontiers inPsychiatry(SCI医学3区,3年平均IF 3.18)杂志的评审编辑,Journal of Magnetic ResonanceImaging、FrontiersAging Neuroscience、Brainresearch、Neuroimage:Report、Scientific Report等多个杂志的审稿人,曾多次受邀在国内外重要学术会议介绍静息态磁共振数据分析。



孙家伟:脑海科技高级数据分析工程师


黄国峰:脑海科技高级数据分析工程师


王晴:脑海科技高级数据分析工程师


4. 培训说明


培训班限额招生15人,报满截止。我们会按照缴费顺序安排座位,为方便会务安排,报名敬请从速。考虑到疫情原因,本次培训每名学员每天发1个口罩。学员需要提供杭州健康码(支付宝首页搜索‘杭州健康码’)。


5. 培训费用


费用包括培训费、资料费、培训期间提供快餐、饮品以及点心,交通及住宿费用自理,每人2900元。本培训班开具可以报销的正式发票。可以现场刷公务卡,培训期间谢绝录像。可以银行卡转账或支付宝付款,支付宝账号:19941364880,杨会云

6. 培训地点


培训地点:浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼10楼,脑海科技第3会议室。

7. 报名方式


请将报名回执以及缴费回执发送至srbrain@126.com,我们会联系您。

8. 联系方式


电话咨询:188 6874 4976

微信咨询:188 6874 4976


9.报名回执表

单位名称(发票抬头)


纳税人识别号(税号)


发票类型(会议费/培训费)


姓名


性别


电话号码


微信


科室/专业


研究方向


银行信息

户名:杭州脑海科技有限公司

账号:3301040160015883146

开户行:杭州银行萧山支行

汇款备注

第02期训练营

10. 在线支持服务


脑海科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持以及合作服务,确保学员能够熟练掌握脑影像数据处理的相关方法。


获取word版本


1. 扫描二维码

2. 使用百度网盘下载:

链接:https://pan.baidu.com/s/1nrAI_7IIBDdh6ocYUyzarQ

提取码:nhkj


3. 请加微信:188 6874 4976 索取word文档。


其他基础训练营培训班:

10月27日- 10月31日,第01期:SVM在脑功能影像数据的应用-机器学习基础实战训练营(点击此处查看详情)


复杂网络专题培训

11月02日-11月07日,第32期:基于图论的复杂网络拓扑指标理论及实操专题培训(点击此处查看详情)


脑白质专题培训:

11月12日- 11月17日,第33期:脑白质功能网络构建及拓扑属性分析专题培训班(点击此处查看详情)

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