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第39期:磁共振脑成像数据分析基础班(8.26-8.31)

发布:2023-08-04    浏览:81 次


第39期:磁共振脑成像数据分析基础班



2023.8.26-2023.8.31(周六~周四)

主办单位:杭州脑海科技有限公司

协办单位:杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心


1. 课程说明


近年来随着技术的不断发展,脑科学引起越来越多研究者的兴趣。目前磁共振已逐渐被广泛应用于神经、精神、消化、认知等医学和心理学领域,用于探索大脑发育、老化、情绪加工、运动障碍及记忆巩固等机制。掌握磁共振数据处理技术变得越来越重要。
本次课程内容相对丰富,几乎涵盖了所有适合初学者掌握的任务态激活分析、静息态功能分析、结构像数据分析以及弥散像的分析。除此之外,我们增加了进阶的算法技术,例如机器学习(支持向量机SVM)、动态功能连接分析(dynamic FC)等。对于已有数据的学员可以快速上手多种模态的数据分析。考虑到没有数据的学员,我们也准备了基于ALE的Meta分析技术,Meta分析作为一种定量方法,能够整合已发表的研究结果来确定哪些脑区存在跨研究一致性。对于手中没有数据的研究人员也能够实现Meta分析的整个研究过程。
本课程为期6天,课程设计环环相扣,为确保大家在6天内可以充分的掌握内容,我们承诺:每期都会根据学员人数安排充足的助教,保证手把手指导分析数据。确保急需掌握数据分析的临床医生以及科研工作者在6天快速掌握需要的数据分析技术。
注:请提前一天到会场2023年08月25日(13:30 - 20:00)安装软件、熟悉场地、拷贝资料等。

2. 简要说明


1) 课程时间充足,在杭州为期6天的系统培训

2) 通过合理的课程设计,为学员后续多模态数据分析打下坚实基础,内容涵盖:

功能:任务态MRI数据分析

    基于BLOCK组块设计的激活分析

    基于EVENT事件相关设计的激活分析

    心理生理交互效应(PPI)分析

功能:静息态MRI数据分析

     局部指标计算(如:ALFF、fALFF、PerAF、ReHo、DC等)

     功能连接(FC)等指标计算

     支持向量机(机器学习SVM)

结构:T1结构像形态学指标分析

     基于体素的形态学分析:原理及应用

     横向数据以及纵向数据的形态学分析方法(CAT12)

弥散像:DTI数据分析

     基于体素水平的分析:FA、MD、AD、RD指标计算

     基于白质骨架的分析:TBSS原理及分析实操

3)基础课程设置合理扎实,内容包含:

     基于坐标的Meta分析(ALE)

     统计分析(1):单样本T检验、双样本T检验、配对双样本T检验

    统计分析(2):多重比较校正原理及操作(FWE、FDR、GRF、AlphaSim以及TFCE等)

     多模态数据分析结果呈现(图以及表的制作)


3. 课程安排

第一天

8月26日

展琳琳

[上午]

静息态功能磁共振入门

9:00 - 12:00
静息态功能磁共振基础概念
RESTplus软件介绍及安装
数据整理、格式转换及图像查看工具
数据预处理原理及实操

[下午]

静息态局部指标计算

14:00 - 17:00
ALFF、fALFF、PerAF原理及实操
KCC-ReHo原理及实操
DC原理及实操

[晚上]
 复习与答疑
18:00 - 20:00
复习与答疑

第二天

8月27日

赵梦琦

[上午]

功能连接、统计分析

9:00 - 12:00
功能连接原理及实操
统计分析及多重比较校正
数据分析小工具:数据重采样、制作mask等

[下午]

形态学分析

14:00 - 17:00
基于体素的形态学分析:原理及应用
横向数据以及纵向数据的形态学分析方法
CAT12软件的应用介绍以及形态学指标的计算
基于体素的形态学分析的统计方法介绍与实操

[晚上]
 复习与答疑
18:00 - 20:00
复习与答疑

第三天

8月28日

王晴

[上午]

任务态激活分析

9:00 - 12:00
基于BLOCK实验设计的一阶激活分析
基于EVENT实验设计的一阶激活分析
SPM二阶分析

[下午]

心理生理交互效应:PPI分析

14:00 - 17:00
PPI原理讲解
PPI研究实例讲解
PPI分析步骤讲解与实操

[晚上]
 复习与答疑
18:00 - 20:00
复习与答疑

第四天

8月29日

黄国峰

[上午]

支持向量机(1)

18:00 - 20:30
支持向量机(SVM)基本概念
线性SVM和非线性SVM的算法原理
libsvm工具包介绍

[下]

支持向量机(2)

18:00 - 20:30
SVM数据归一化与参数选择讲解
基于SVM结果的图表制作及注意事项

[晚上]
 复习与答疑
18:00 - 20:00
复习与答疑

第五天

8月30日

李杰

[上午]

动态分析原理与实操

9:00 - 12:00
Dynamic发展及优势介绍
Dynamic常用方法介绍
Dynamic FC、ALFF原理讲解
滑动窗方法原理及窗参选择

[下午]

动态实操、统计分析

14:00 - 17:00
基于FLS计算的dFC操作
dFC变异指标的统计分析
Dynamic的结果报告与呈现
赵梦琦


[晚上]

基于ALE的脑影像元分析

18:00 - 20:30
ALE软件介绍
基于ALE脑影像元分析流程
ALE软件元分析实操

第六天

8月31日

郝泽奇

[上午]

弥散像分析:体素水平的分析

9:00 - 12:00
Linux入门
DTI基础原理
DTI数据分析操作基本流程及FSL初步使用
FA、MD、AD、RD指标计算

[下午]

弥散像分析:基于白质骨架水平的分析

14:00 - 17:00
TBSS数据分析原理介绍
TBSS数据分析步骤解读及实操
DTI数据分析结果呈现



备注:请各位学员自带笔记本电脑,建议电脑配置:windows 64位系统、8G以上内存、200G以上剩余硬盘空间。请尽量携带Windows电脑,如果只能使用苹果MAC电脑,请提前使用Bootcmap安装windows 64位系统


4. 脑海科技研发团队介绍


贾熙泽,杭州脑海科技首席执行官,常熟市第二人民医院磁共振脑成像研究中心副主任、特聘研究员,大连市友谊医院特聘教授,潍坊医学院附属医院特聘专家,佳木斯大学信息电子技术学院硕士生导师,兼任杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心副研究员。现任中国心理学会积极心理学专委会委员、浙江省数理医学学会放射学专委会委员和浙江省康复医学会神经调控专委会委员。具有计算机、心理学及神经科学交叉背景,擅长静息态磁共振方法学、基于脑影像的Meta分析,并师从任俊教授从事脑影像技术在积极心理学中的应用。目前主持国家自然科学青年基金项目,浙江省智能教育技术与应用重点实验室开放研究基金重点项目,入选杭州市青年科技人才培育工程项目,作为主要参与人参与8项国自然科学基金项目、1项科技部国家重大慢性非传染性疾病重点研发计划课题。师从臧玉峰教授,开发了RESTplus。目前合作发表SCI论文40余篇,以主要作者在Science Bulletin、The Journal of Headache and Pain及Journal of Affective Disorders等杂志发表文章20余篇(第一作者或通讯作者),文章被SCI杂志引用679 余次,i10-index=19。
杭州脑海科技有限公司于2021年组建了杭州脑海科技有限公司认知神经科学实验室,主要从事最新脑影像算法的复现、研发及在脑疾病中的应用。授课教师均来自杭州脑海科技有限公司认知神经科学实验室,目前团队成员50余人,具有高度交叉背景,涵盖:计算机、统计学、心理学、临床医学以及英语等专业,每位成员受过系统化的科研培训,具有扎实的科研背景并专攻1-2个研究方向。2021年至今,团队成员以主要作者在Science Bulletin、 Human brain mapping、The Journal of Affective Disorders、The Journal of Headache and Pain等期刊发表SCI文章30余篇,其中的核心成员具有比较扎实的大脑功能信号相关的科研基础,担任多个杂志的编辑或审稿人,包括:IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics、Human Brain Mapping、Cerebral Cortex、CNS Neuroscience & Therapeutics、Journal of Affective Disorders、Neuroimage: Clinical、Neuroimage: Report、Journal of Magnetic Resonance Imaging、European Child & Adolescent Psychiatry、Social Cognitive and Affective Neuroscience、Journal of Sleep Research、World Journal of Diabetes.、International Journal of Geriatric Psychiatry、Frontiers in Aging Neuroscience、Brain research、Neural Plasticity、Frontiers in Neuroscience、Scientific report、BMC Medical Imaging等20余个杂志。

5. 培训说明


培训班限额招生20人,报满截止。为方便会务安排,报名敬请从速。

6. 培训费用


费用包括培训费、资料费、培训期间提供快餐、饮品以及点心,交通及住宿费用自理,每人3500元。本培训班开具可以报销的正式发票。可以现场刷公务卡或银行卡转账,培训期间谢绝录像及录音

7. 培训地点


培训地点:浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼4楼,第8会议室。

8. 报名方式


请将报名回执以及缴费回执发送至lixue@fmri123.com,我们会联系您。

9. 联系方式


电话咨询:0571-2883 4398(请按3号键)

微信咨询:191 5785 0159


10.报名回执表

单位名称(发票抬头)


纳税人识别号(税号)


发票类型(会议费/培训费)


姓名


性别


电话号码


微信


科室/专业


研究方向


银行信息

户名:杭州脑海科技有限公司

账号:3301040160015883146

开户行:杭州银行萧山支行

汇款备注

第39期:磁共振脑成像数据分析基础班

11. 在线支持服务


脑海科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持服务,确保学员能够熟练掌握脑影像数据处理的相关方法。

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链接:

https://pan.baidu.com/s/1lJHVvg3VAFtrgaqpWT2n2A

提取码:nhkj


3. 请加微信:19157850159索取word文档。

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