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8.3-8.4培训 | 因果结构协变网络分析(CaSCN) | AN02C (杭州)

发布:2024-07-27    浏览:99 次


主办单位

杭州脑海科技有限公司

脑海科技认知神经科学实验室

承办单位

杭州脑呈科技有限公司

01

 脑海科技脑影像数据分析学习中心介绍






1)杭州脑海科技有限公司下属的认知神经科学实验室(脑海科技认知神经科学实验室)专注于神经影像相关的学术工作,实验室核心团队组建于2018年,为方便实验室同学体系化的掌握脑影像数据分析技术,实验室于2021年成立了脑影像数据分析学习中心。脑海实验室目前已累积联合培养硕士研究生41名、博士研究生12名。截止目前,实验室成员累积发表SCI文章85其中JCR一区SCI文章28篇,JCR二区SCI文章41篇。实验室研究团队有着丰富的脑影像研究经验,联合培养了很多优秀的研究生,如:高*艳以主要作者发表SCI文章5篇、郝*奇以主要作者发表SCI文章6篇、李*婷以主要作者发表SCI文章6篇、孙*伟以主要作者发表SCI文章4篇、王*以主要作者发表SCI文章3篇、展*琳以主要作者发表SCI文章3篇等等(鉴于篇幅所限,仅列举部分同学)。
2)学习中心导师及助教团队有着极其丰富的答疑经验:前期我们已经积累大量学术指导经验,目前已有近百余名研究生或医生的联合培养或短期访学的合作经验,截止目前,实验室成员累积发表SCI文章85篇,其中JCR一区SCI文章28篇,JCR二区SCI文章41篇
3)学习中心核心团队具有丰富的SCI文章审稿经验,担任50余个SCI杂志审稿人,包括:Alzheimer's Research & Therapy、Molecular Autism、IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics、NeuroImage、BMC Psychiatry、Human Brain Mapping、Translational Stroke Research、CNS Neuroscience & Therapeutics、Journal of Affective Disorders、Autism Research等等。
4)脑海科技团队具有高度交叉背景,背景涵盖:计算机、数学、生物医学工程、心理学、英语、认知神经科学以及临床医学。每名成员均受过体系化科研培训,具有扎实的科研背景并专攻1-2个研究方向。

02

 AN02C线下面授课程介绍


课程名称:AN02C | 因果结构协变网络分析 | Causal structural covariance network (CaSCN)analysis 

编号:AN02C 


课程分类:C


学习时长2


培训时间:2024年8月3日-4日(2天)


培训地点:浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼4楼,第8会议室。


我们承诺:每期都会根据学员人数安排充足的助教,保证手把手指导分析数据。确保急需掌握数据分析的临床医生以及科研工作者快速掌握需要的数据分析技术。


其他备注:请提前一天到会场2024年8月2日(13:30 - 20:00)安装软件、熟悉场地、拷贝资料等。我们鼓励学员带上自己的研究数据来参加课程。届时,我们将竭诚为您提供个性化的指导和帮助,最大化地利用您的数据进行实操练习,以加深对课程内容的理解和掌握。

请各位学员自带笔记本电脑,建议电脑配置:windows 64位系统、8G以上内存、200G以上剩余硬盘空间。请尽量携带Windows电脑,如果只能使用苹果MAC电脑,请提前使用Bootcmap安装windows 64位系统。

















授课内容简介


本期课程以Chen et al., 2020发表在Neuropsychopharmacology期刊(一区,影响因子8.2分)上使用的基于因果结构协变网络分析(CaSCN)方法为教学蓝本。CaSCN允许使用横向结构像数据来分析大脑结构网络的渐进式变化,并评估网络区域之间形态测量变化的因果关系,即时间优先关系。

Neuropsychopharmacology期刊信息

参考文献:
Zhang Z, Liao W, Xu Q, Wei W, Zhou HJ, Sun K, Yang F, Mantini D, Ji X, Lu G. Hippocampus-associated causal network of structural covariance measuring structural damage progression in temporal lobe epilepsy. Hum Brain Mapp. 2017 Feb;38(2):753-766. doi: 10.1002/hbm.23415. Epub 2016 Sep 28. PMID: 27677885; PMCID: PMC6866709.
Chen Y, Cui Q, Fan YS, Guo X, Tang Q, Sheng W, Lei T, Li D, Lu F, He Z, Yang Y, Hu S, Deng J, Chen H. Progressive brain structural alterations assessed via causal analysis in patients with generalized anxiety disorder. Neuropsychopharmacology. 2020 Sep;45(10):1689-1697. doi: 10.1038/s41386-020-0704-1. Epub 2020 May 12. PMID: 32396920; PMCID: PMC7419314.
Li, R., Zou, T., Wang, X., Wang, H., Hu, X., Xie, F., Meng, L., & Chen, H. (2022). Basal ganglia atrophy-associated causal structural network degeneration in Parkinson's disease. Human brain mapping, 43(3), 1145–1156. https://doi.org/10.1002/hbm.25715

课程安排


时间课程主题

8月3日

第一天

王晴

上午

9时-12时

CaSCN方法概述及脑疾病应用

基于不同病程阶段的VBM分析

8月3日

第一天

王晴

下午

14时-17时

CaSCN理论讲解

种子点的选取及选择策略

基于REST的CaSCN分析

统计分析与多重比较校正

图表制作与结果汇报

8月3日

第一天

柴倩琳

晚上

19时-21时
复习与答疑

8月4日

第二天

王晴

上午

9时-12时

基于RESTplus的CaSCN分析

统计分析与多重比较校正

图表制作与结果汇报

8月4日

第二天

王晴

下午

14时-17时

BCCT工具包介绍

基于BCCT的CaSCN分析

统计分析与多重比较校正

图表制作与结果汇报

8月4日

第二天

柴倩琳

晚上

19时-21时
复习与答疑
















03

 脑海科技相关介绍






脑海科技设立于萧山区紫橙国际创新中心3号楼10层,是一家专注于脑影像相关的科研平台研发、技术培训、数据分析技术服务及脑科学相关设备销售的科技型公司,已被认定为“国家级高新技术企业”、“国家级科技型中小企业”、“浙江省创新型中小企业”及“浙江省科技型中小企业”,入选杭州市萧山区高层次人才创业创新“5213”领航类项目,并经杭州市科协审批建立了“博士创新站”。

贾熙泽,博士,杭州脑海科技首席执行官,现任山东第二医科大学附属医院特聘专家、常熟市第二人民医院磁共振脑成像研究中心副主任、特聘研究员、兼任杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心副研究员、大连市友谊医院特聘教授、山东第二医科大学医学影像学院硕士生导师、宁波市康复医院医学技术顾问、佳木斯大学信息电子技术学院硕士生导师、中国心理学会积极心理学专委会委员、浙江省数理医学学会放射学专委会委员、浙江省康复医学会神经调控专委会委员及杭州市萧山区青年科技工作者协会会员。主持国自然青年基金项目、浙江省智能教育技术与应用重点实验室开放研究基金重点项目,入选杭州市青年科技人才培育工程项目,作为主要参与人参与 8 项国自然科学基金项目、 1 项科技部国家重大慢性非传染性疾病重点研发计划课题。目前合作发表 SCI 论文 30 余篇,以主要作者在Science Bulletin、 Human Brain Mapping、 The Journal of Headache and Pain 及 Journal of Affective Disorders 等杂志发表文章 30 余篇(第一作者或通讯作者),文章被 SCI 杂志引用近968次,h-index =16,担任 40余个SCI杂志的审稿人。

04

 报名费用及相关说明






1)面授课程费用包括培训费、资料费,交通及住宿费用自理,每人1980元。转发朋友圈集赞超过28个赞,可享受限时优惠价1780元
2)本培训班开具可以报销的正式发票。可以现场刷公务卡或银行卡转账,培训期间谢绝录像及录音。
面授课程限额招生9人,报满截止。为方便会务安排,报名敬请从速。

05

 报名流程与付款方式






1)报名流程。报名可先扫描以下二维码添加樊衍孜微信(扫描以下二维码或添加微信号:19906719439),我们将与您电话沟通学习需求及目标,并出具学习计划及对应报价单。完成付款后,即可开始预约学习,随到随学。

2)关于发票。可开具能够报销的正式发票(如:技术服务费及培训费等)。支持预存,可以现场刷公务卡或银行卡转账,学习期间谢绝录像及录音。
电话咨询:0571-2883 4398(请按3号键)
微信咨询:199 0671 9439
邮箱咨询:fanyanzi@brainimaging.cn

06

 更多学习方案欢迎详询






以下训练营已开营!每个训练营包含多名数据分析经验丰富的主讲老师的课程,他们将倾囊相授,帮助学员们掌握数据分析的核心技巧。训练营信息如下,敬请关注“脑影像工坊”公众号:
训练营-01:每课时低至38元 | 全年随到随学 | 静息态数据分析基础训练营 | RS02A(点击此处跳转至RS02A训练营,主要内容包含:10套静息态数据分析课程,涵盖静息态功能磁共振基础入门,静息态指标计算(ALFF、fALFF、PerAF、Wavelet-ALFF、KCC-ReHo、Cohe-ReHo、DC、FC、GCA),盲反卷积、统计分析、多重比较校正、静息态文献解读、结果汇报图表制作及注意事项

训练营-02:弥散张量成像(DTI)数据分析基础训练营 | 全年随到随学| DT01A(点击此处跳转至DT01A训练营,主要内容包含:DTI指标计算(FA、AD、RD、MD)与基于白质骨架的统计分析(TBSS)

训练营-03:基于体素的形态学分析-VBM训练营 | 全年随到随学 | AN01A(点击此处跳转至AN01A训练营,主要内容包含:包含横向数据的灰质体积计算、纵向数据的灰质体积计算、ROI区域体积值的提取等。包括理论+数据分析+案例实战。

训练营-04:大脑复杂网络数据分析基础训练营| 全年随到随学| GT01A(点击此处跳转至GT01A训练营,主要内容包含:功能像数据的全局指标(小世界属性、网络效率、最短路径长度等)、节点指标(度中心、介数等)计算;基于个体形态学网络创建、全局指标(小世界属性、网络效率、最短路径长度等)、节点指标(度中心、介数等)计算等。包括理论+数据分析+案例实战。

训练营-05:独立成分分析与网络间连接基础训练营(ICA+FNC)| 全年随到随学 | IC01A(点击此处跳转至IC01A训练营,主要内容包含:包含GIFT工具包实操、ICASSO分析、降维、FNC讲解等。包括理论+数据分析+案例实战。

训练营-06:扩散峰度成像(DKI)数据分析基础训练营| 全年随到随学 | DK01A(点击此处跳转至DK01A训练营,主要内容包含:包含DKI指标计算、纤维追踪等。包括理论+数据分析+案例实战。

训练营-07:白质功能信号数据分析基础训练营| 全年随到随学| WM01A(点击此处跳转至WM01A训练营,主要内容包含:包含白质信号特殊预处理讲解、白质体素水平的局部指标计算、白质脑网络的构建、聚类方法讲解等。包括理论+数据分析+案例实战。

训练营-08:基于大脑皮层的数据分析基础训练营| 全年随到随学| SF01A(点击此处跳转至SF01A训练营,主要内容包含:FreeSurfer基础操作,皮层指标(皮层厚度、曲率、沟深、皮层复杂度)等计算,FreeSurfer组水平分析等。包括理论+数据分析+案例实战。

训练营-09:基于机器学习技术的脑影像数据分析基础训练营| 全年随到随学 | ML01A(点击此处跳转至ML01A训练营,主要内容包含:包含支持向量机原理、特征空间、核函数讲解、交叉验证方法等讲解与实操。包括理论+数据分析+案例实战。

训练营-10:脑影像元分析(META)基础训练营| 全年随到随学 | ME01A(点击此处跳转至ME01A训练营,主要内容包含:元分析文献解读,元分析操作流程讲解,基于AES-SDM工具箱的元分析,基于ALE工具箱的元分析,敏感性分析、亚组分析、异质性分析、回归分析讲解等。包括理论+数据分析+案例实战。

训练营-11:基于AFNI的数据分析基础训练营 | 全年随到随学 | AF01A 点击此处跳转至AF01A训练营,主要内容包含:AFNI基础概念、AFNI图形界面讲解、使用AFNI进行预处理、指标计算、统计分析讲解等,AFNI内置命令讲解与实操。

此外,还会陆续推出涵盖更多技术的课程包含但不限于:
1)任务态数据分析:任务态激活分析、心理生理交互效应(PPI)、动态因果模型(DCM)、多体素模式分析(MVPA)......
2)定量磁化率成像(QSM):包含QSM图像的创建与标准化、QSM信号值的提取等
3)沿血管周围间隙弥散张量成像分析 (DTI-ALPS)
4)基于组水平结构网络分析:包含组水平结构网络的创建、全局指标、节点指标计算,网络攻击性分析、HUB节点识别
5)深度学习在脑影像数据中的应用(如生成对抗网络、强化学习、迁移学习等)
......
如有其他想要学习的内容,欢迎添加樊衍孜的微信反馈(微信号:19906719439),我们将研发新的学习方案。
















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