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第一期 多模态磁共振成像数据处理培训班

发布:2018-12-21    浏览:89 次

点击左上角"拾睿科技"四个字,即可关注。拾睿科技专注于脑科学研究,包括了fMRI,DTI,ASL等,希望这些内容能给关注者带来帮助,同时也非常欢迎参加拾睿科技的课程。


1.    培训简介

近年来随着技术的不断发展,脑科学引起越来越多研究者的兴趣。磁共振作为一种安全无创的研究工具,已逐渐被广泛应用于神经、精神、消化等医学领域以及大脑发育、情绪加工、记忆巩固等心理学领域。由于大脑的复杂性,让我们可以通过一批数据,从不同角度去研究大脑神经活动并发表SCI文章,掌握磁共振数据处理技术变得越来越重要。合理的运用静息态功能磁共振局部活动分析方法(RS-fMRI)、独立成分分析(ICA)、基于DTI的纤维追踪、以及基于皮层的大脑结构分析等技术让我们可以从多模态、多角度探究大脑内在神经活动。为了让学员全面掌握以上技术,本期培训课程设计由浅入深,同时涵盖功能像数据分析以及结构像数据分析,让学员可以系统的掌握低频振幅(ALFF),局部一致性(ReHo)、基于图论的度中心度(DC)、功能连接(FC)、独立成分分析(ICA)等脑功能数据分析方法。结构像数据分析包括: 弥散张量成像(DTI)数据分析、扩散峰度成像(DKI)数据分析以及皮层厚度分析等技术。除了方法学外,本期培训班还由浅入深的介绍了统计检验、多重比较校正、脑图制作以及各种脑科学实用工具。为了使参与培训的朋友快速开展相应技术的研究,我们的课程设计上不仅介绍理论,更注重实践操作。培训班配备充足的助教,希望通过此次培训,能帮助到广大临床医生及科研工作者熟练掌握脑影像数据处理技能,从而在研究道路越走越远。

2.   内容安排与特色

本期内容包括:

1)静息态功能磁共振数据预处理技术

2)局部一致性(ReHo)、低频振幅(ALFF)、比率低频振幅(fALFF)、度中心度(Degree centrality)、功能连接(Functional connectivity)等方法

3)统计检验、多重比较校正、做图、实用脑科学工具

4)DTI以及DKI的原理及数据分析技术

5)独立成分分析原理及数据分析技术

6)基于Freesurfer软件的皮层分析技术

  本培训班课程设计重视实战操作,重点讲解软件使用及处理数据时常见问题,并提供丰富的例子数据,配备充足的助教,协助学员系统的掌握数据分析技术。参加培训的学员可以获得我们长期的技术服务和在线答疑。

 本次培训班适合对fMRI基本概念有一些了解,但数据分析薄弱的学员,本次培训重点讲解数据分析的软件操作与实践。

注:如果方便,请提前一天到会场(2月26日 13:30 - 18:00)安装软件、熟悉场地、拷贝资料等。


3. 课程安排


时间
课程名称

02.27

周三

臧玉峰

8:30 - 10:00

  • 静息态功能磁共振概论

贾熙泽

10:00 - 12:00

  • RESTplus数据预处理

  • RESTplus数据后处理(ReHo,ALFF,fALFF, PerAF, Degree centrality, Functional connectivity)

  • 统计分析

贾熙泽

14:00 - 17:00

从数据整理到结果呈现(模拟完成一项研究工作)

  • 整理数据

  • 进行预处理及多种后处理指标分析

  • 质量控制与被试排除

  • 统计分析,协变量回归,多重比较校正

贾熙泽

19:00 - 21:00

从数据整理到结果呈现(模拟完成一项研究工作)

  • 基于统计结果制作MASK

  • 和临床量表做相关

  • 图表制作与结果呈现‍‍

02.28

周四

陈兵

8:30 - 10:00

  • Linux系统介绍

  • Linux软件安装与常用命令

  • Linux虚拟机的使用

刘小征

10:00 - 12:00

  • DTI的原理,数据采集标准及常用分析方法简介

  • 基于体素的VBM

  • 基于纤维骨架的TBSS

  • 基于神经追踪纤维束分析

刘小征

14:00 - 17:00

  • DKI原理,数据采集标准

  • DKI数据预处理

  • DKI相关指标计算

  • 基于DKI的纤维束分析

  • 上机操作

03.01

周五

吕亚婷

9:00 - 12:00

  • DTI的原理以及常用指标的介绍

  • FSL中处理DTI数据模块介绍(FDT)

  • 实际操作FDT

14:00 - 17:00

  • PANDA的介绍

  • 实际操作PANDA

03.02

周六

胡杨

9:00 - 12:00

使用ICA分析静息态fMRI数据(网络分析,多元分析)具体包括:

  • 个体水平ICA算法原理

  • 组水平ICA算法原理

  • 使用ICA进行脑网络分析的常用指标(网络内功能连接、网络间功能连接)

14:00 - 17:00 

使用GIFT进行ICA分析,具体包括:

  • 使用GUI(图形界面)分析静息态数据的基本流程

  • 使用SPM对ICA结果进行统计分析

  • GIFT其他常用小技巧(比如使用脚本进行分析,参数调试等)

03.03

周日

张一文

9:00 - 12:00

Freesurfer数据处理:

  • 原理介绍

  • Freesurfer核心指令:recon-all

14:00 - 17:00

  • 皮层指标thickness的计算

  • 计算结果及文件说明

  • Freesurfer查看结果


‍‍备注:请各位学员自带笔记本电脑,建议电脑配置:windows 64位系统、4G以上内存、40G以上剩余硬盘空间


4. 授课老师

臧玉峰:医学博士。杭州师范大学认知与脑疾病研究中心教授。近年来一直从事静息态功能磁共振影像的计算方法学及其在认知与脑疾病的应用研究。与同事一道,提出“局部一致性”和“低频振幅”等方法,并将这些方法用于各种脑疾病以及认知科学领域的研究。带领研究团队开发了REST等软件,被国际上约2000篇英语论文应用。开设了静息态功能磁共振论坛(http://www.restfmri.net),该网站浏览量一百多万次。合作发表英语论文100多篇,Google Scholar数据库引用19851次(h指数64)。2014到2017年连续四年入选Elsevier“中国高被引学者”(神经科学领域),2017年入选Clarivate 全球高被引学者(神经与行为科学)。

吕亚婷:博士,现任杭州师范大学认知与脑疾病研究中心臧玉峰教授课题组担任副研究员,硕士毕业于中国科学院自动化研究所模式识别与智能系统国家重点实验室,2013年博士毕业于德国马克思普朗克人类认知与脑科学研究所。以第一作者或通讯作者在Annals of Neurology(影响因子 10.25分)、Science Reports等期刊发表多篇SCI论文。获得两项国自然科学基金(青年,面上),科技部国家重点研发计划子课题负责人,NeuroImage,NeuroImage: Clinical, PloS One, Science Bulletin, Frontiers等杂志的审稿人。

刘小征:博士,温州医科大学附属第二医院脑功能研究所。主要研究方向为脑白质成像方法和精神类疾病的发病机制及早期诊断研究。DTI分析软件:DTI BrainImageScope的主要开发者。发表SCI论文20余篇,其中第一或通讯作者12篇。顶级算法会议MICCAI三篇。

张一文:硕士,毕业于南昌大学应用心理学专业和中国科学院心理研究所认知神经科学专业。2017毕业至今于上海市精神卫生中心研究所办公室心理健康与脑影像研究中心担任研究实习员,研究方向为心理健康领域的神经影像研究。使用基于皮层的影响分析方法,对轻度认知损伤病人大脑局部至长程功能连接进行了研究,结果以第一作者身份在Neurobiology of Aging发表论文一篇(影响因子5.1分)。参与数据采集与分析的项目,以共同作者身份在Science Bulletin和Games for Health发表论文两篇。

胡杨: 硕士,中科院心理所认知神经科学专业,主要研究方向为独立成分分析的方法学研究,熟悉ICA算法原理以及GIFT、Melodic等常见ICA数据分析工具包,曾以第一作者发表1篇ICA方法学方面的SCI文章。

贾熙泽:工学学士(计算机),心理学硕士,杭州拾睿科技有限公司。RESTplus软件的主要开发人。主要研究方向为静息态功能磁共振方法学、数据分析软件开发。合作发表多篇SCI文章,曾多次受邀在国内外重要学术会议介绍静息态磁共振数据分析,其中包括:Fifth Biennial Conference on Resting State / Brain Connectivity (Vienna) 等。

5. 培训人数

培训班限额招生28人,报满截止。为方便会务安排,报名敬请从速。

6. 培训费用

每人3800元,包括培训费、资料费;交通及住宿费用自理。本培训班开具可以报销的正式发票。不支持现场刷卡,培训期间谢绝录像。可以银行卡转账或支付宝付款,支付宝账号:jiaxize@foxmail.com,杭州拾睿科技有限公司

7. 培训地点

培训地点:杭州师范大学仓前校区(浙江省杭州市余杭区仓前街道余杭塘路2318号),具体见会议指南。

8. 报名方式

请将报名回执发送至srbrain@126.com,我们会联系您。

9. 联系方式

联系人:李仔麒

电话:157 6534 4036

报名回执表:


单位名称(发票抬头,纳税人识别号)


发票类型(会议费培训费)


姓名


性别


电话号码


微信


科室/专业


研究方向


银行信息

户名:杭州拾睿科技有限公司

账号:3301040160010744277

开户行:杭州银行官巷口支行

汇款备注

第一期 多模态磁共振成像数据处理培训班



下载word版回执表可点击阅读原文,也可进入百度网盘下载:


https://pan.baidu.com/s/1A5YLyjGGNVTOPofMXeOjbQ

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