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磁共振结构数据分析(VBM)基础训练营|全年随到随学|AN01A

发布:2024-07-12    浏览:86 次


主办单位

杭州脑海科技有限公司

脑海科技认知神经科学实验室

承办单位

杭州脑呈科技有限公司


















1. 脑海科技脑影像数据分析学习中心介绍


杭州脑海科技有限公司下属的认知神经科学实验室(脑海科技认知神经科学实验室)专注于神经影像相关的学术工作,实验室核心团队组建于2018年,为方便实验室同学体系化的掌握脑影像数据分析技术,实验室于2021年成立了脑影像数据分析学习中心。脑海实验室基于学习中心的模式,目前已累积联合培养硕士研究生41名、博士研究生12名。截止目前,实验室成员累积发表SCI文章85篇,其中JCR一区SCI文章28篇,JCR二区SCI文章41篇

鉴于之前的传统培训班的效果难以达到我们的预期,经过团队慎重的考虑,我们将学习中心内容改进升级后,决定将其对外开放申请,相对于传统的培训模式,有以下优势:
1) 随到随学:学习中心全年开放可根据自己的时间预约学习
2) 以小组为单位教学:传统培训班模式每期20~30人,老师很难兼顾不同基础的同学,小组答疑通常一个小组为5人左右,以小组为单位教学及答疑,更高的学习效率
3) 完善的硬件体系:每名学员均配置2台高性能工作站(Intel i7或以上配置),一台用于观看教学视频,另一台用于练习数据分析操作
4) 完善的课程资料体系:包括体系化的数据分析技术视频、理论课程、学习文档以及完整的案例数据,反复看、重复看、体系化系统的学习
5) 支持一对一教学:如有需要,可提供一对一教学及答疑,定制培养方案和学习体系
6) 实验室研究团队有着丰富的脑影像研究经验,联合培养了很多优秀的研究生,如:高*艳以主要作者发表SCI文章5篇、郝*奇以主要作者发表SCI文章6篇、李*婷以主要作者发表SCI文章6篇、孙*伟以主要作者发表SCI文章4篇、王*以主要作者发表SCI文章3篇、展*琳以主要作者发表SCI文章3篇等等(鉴于篇幅所限,仅列举部分同学)。
7) 学习中心导师及助教团队有着极其丰富的答疑经验:前期我们已经积累大量学术指导经验,目前已有近百余名研究生或医生的联合培养或短期访学的合作经验,截止目前,实验室成员累积发表SCI文章85篇,其中JCR一区SCI文章28篇,JCR二区SCI文章41篇
8) 学习中心核心团队具有丰富的SCI文章审稿经验,担任50余个SCI杂志审稿人,包括:Alzheimer's Research & Therapy、Molecular Autism、IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics、NeuroImage、BMC Psychiatry、Human Brain Mapping、Translational Stroke Research、CNS Neuroscience & Therapeutics、Journal of Affective Disorders、Autism Research等等。
9) 脑海科技团队具有高度交叉背景,背景涵盖:计算机、数学、生物医学工程、心理学、英语、认知神经科学以及临床医学。每名成员均受过体系化科研培训,具有扎实的科研背景并专攻1-2个研究方向。


2. AN01A训练营介绍


脑影像数据分析学习中心即将推出一系列学习方案,每套学习方案具有唯一编号,大家既可以选择已有学习方案报名,也可以自行提出需求,我们将根据您的实际需求推出新的学习方案体系。我们真诚的希望尽可能灵活的满足大家的需求。
训练营名称:AN01A | 磁共振结构数据分析基础班
训练营编号:AN01A 
课程分类:A
学习时长:2天
课程体系:一共包括1套完整课程,确保大家学会,学全,实打实的掌握技术
总课时数:9课时(每课时45分钟)
硬件配置:每名学员独享1台用于观看学习视频的电脑,独享1台用于分析数据的工作站(Intel i7或以上配置)
助教答疑:3-5人为一组,即1名助教负责3-5人的答疑
案例数据:提供3批难度不同的完整案例数据用于实操
学习目标:深入理解静息态功能磁共振领域的多个维度与应用,模拟科研一线的课题数据分析环境,让学员在实践中锻炼技能,将理论知识转化为实际操作能力,为将来独立开展科研项目奠定坚实基础。

//训练营日程规划//


每名学员有专属导师定期跟进学习进展,协助调整学习计划

时间范围主题学习目标课后作业与学习效果评估

第1天

上午

熟悉数据
  • 认识结构像数据
  • 了解常用的结构像数据分析方法
  • 掌握基于体素的形态学分析流程
  • 熟悉CAT12工具包

整理案例数据中结构像的扫描参数及序列特性

第1天

下午

横向数据的VBM分析
  • 掌握横向数据集的分割、标准化、平滑操作
  • 掌握结构像数据质量的查看
  • 掌握灰质体积的统计分析与多重比较校正
  • 掌握皮层指标(层厚、沟深、皮层复杂度)计算



学习横向数据分割方法及标准化步骤,查看分割报告、灰白质及脑脊液分割文件、Label文件等

学习结构像数据质量查看,皮层指标的提取(特定脑区的沟深、层厚、皮层复杂度、回旋指数)


第1天

晚上

文献导读与复习
  • 已发表VBM文献导读

  • 了解VBM的文献撰写方式

结合应用类文献对VBM的结果和方法部分进行整体的回顾

第2天

上午

纵向数据的VBM分析
  • 掌握纵向数据集的分割、对齐、标准化、平滑操作

  • 掌握结构像数据质量的查看

  • 掌握灰质体积的统计分析与多重比较校正

  • 掌握皮层指标(层厚、沟深、皮层复杂度)计算

学习纵向数据分割方法及标准化步骤,查看分割报告、灰白质及脑脊液分割文件、Label文件等

第2天

下午
案例实战
  • 独立使用案例数据进行数据分割、统计分析等

  • 掌握CAT12内置小工具的应用场景及使用

独立整理案例数据使其符合数据分析要求的格式,对数据进行从格式转换到多重比较校正的完整流程操作

第2天

晚上
结果汇报与复习
  • 独立制作图表进行结果报告

  • 复习VBM内容

结合应用类文献对VBM的结果和方法部分进行整体的回顾

本期训练营涵盖的课程视频资


学习说明:导师会根据训练营规划与学员基础,为学员推荐相应课程,学员可自主选择回放、倍速、快进等功能,灵活把握学习进度。通过:导师跟进制度 + 体系化课程视频 + 体系化学习资料 +  数据分析模拟实战训练 +  助教现场指导的方式,确保完整掌握科研需要的所有技术细节。


AN01-1:基于体素的形态学分析-主讲老师 王晴


AN01-1:基于体素的形态学分析-主讲老师 王晴

本课程专为初学者量身定制,聚焦于基于体素的形态学分析(VBM)的教学。通过系统学习,学员将了解当前结构像数据的主流分析技术,尤其在MATLAB环境下结合CAT12工具包,实现结构像数据的精细处理。课程内容覆盖了从全脑灰质体积到基于特定ROI(感兴趣区域)的灰质体积定量分析,以及深入到皮层指标(皮层厚度、复杂度、沟回指数)的计算。为确保学员能够多维度掌握VBM分析,我们精心准备了实际案例数据与精选文献资料,鼓励学员进行深度阅读、实践复现等练习,旨在培养学员独立分析数据、解读科研成果的能力,为他们在神经影像学研究领域的发展奠定坚实的基础。通过本课程的学习,学员不仅能够熟练运用VBM技术,还能深刻理解其在认知神经科学、临床诊断等领域的应用潜力。
课程编号:AN01-1
主讲老师课程名称具体内容

课时数

(每课时45分钟)
王晴01 结构像分析概述

结构像数据及扫描参数介绍

结构像数据分析方法概述

基于体素的形态学分析流程讲解

CAT12工具包介绍

VBM应用案例介绍

2课时
02 VBM讲解与实操

横向实验设计的结构像分割方法

纵向实验设计的结构像分割方法

数据质量检查注意事项

统计分析与多重比较校正

皮层指标计算(层厚、沟深、皮层复杂度等)

CAT12小工具使用讲解与实操

5课时
03 VBM文献导读

已发表文献案例方法部分导读

已发表文献案例结果部分导读

1课时
04 项目实战

VBM实战

灰质体积统计差异脑图制作

灰质体积统计差异三线表制作


1课时

3. 脑海科技相关介绍


脑海科技设立于萧山区紫橙国际创新中心3号楼10层,是一家专注于脑影像相关的科研平台研发、技术培训、数据分析技术服务及脑科学相关设备销售的科技型公司,已被认定为“国家级高新技术企业”、“国家级科技型中小企业”、“浙江省创新型中小企业”及“浙江省科技型中小企业”,入选杭州市萧山区高层次人才创业创新“5213”领航类项目,并经杭州市科协审批建立了“博士创新站”。 

贾熙泽,博士,杭州脑海科技首席执行官,现任山东第二医科大学附属医院特聘专家、常熟市第二人民医院磁共振脑成像研究中心副主任、特聘研究员、兼任杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心副研究员、大连市友谊医院特聘教授、山东第二医科大学医学影像学院硕士生导师、宁波市康复医院医学技术顾问、佳木斯大学信息电子技术学院硕士生导师、中国心理学会积极心理学专委会委员、浙江省数理医学学会放射学专委会委员、浙江省康复医学会神经调控专委会委员及杭州市萧山区青年科技工作者协会会员。主持国自然青年基金项目、浙江省智能教育技术与应用重点实验室开放研究基金重点项目,入选杭州市青年科技人才培育工程项目,作为主要参与人参与 8 项国自然科学基金项目、 1 项科技部国家重大慢性非传染性疾病重点研发计划课题。目前合作发表 SCI 论文 30 余篇,以主要作者在 Science Bulletin、 Human Brain Mapping、 The Journal of Headache and Pain 及 Journal of Affective Disorders 等杂志发表文章 30 余篇(第一作者或通讯作者),文章被 SCI 杂志引用近968次,h-index =16,担任 40余个SCI杂志的审稿人。

4. AN01A训练营报名费用及相关说明


根据我们的前期实战,学习中心模式相对于传统培训班模式效果更好。传统的培训班通常在6天内集中式现场短时间内讲授大量知识点,学员很容易跟不上。另一种方法是线上课程,该方式价格也要数千元,根据已有经验而言,由于学员基础不同、背景不同,效果很难达到预期,并且也存答疑不方便等问题。

目前,磁共振结构数据分析基础训练营涵盖以下内容:

1)学习时长:2天(时间可续)

2)独享视频电脑:1台

3)独享高性能工作站:1台(配置intel i7以上),不需要自带电脑,高性能的硬件,让学习效率更高

4)专属导师:定期跟进学习进展,协助调整学习方案

5)小组答疑:助教现场答疑与指导,每个小组3-5人

6)考核与测验:考核与测验评估学习进展,提出改进建议与查漏补缺

另外,对于有更高需求的学员,还可以支持一对一答疑等方式,欢迎咨询。


报名费用:
原价:2280元(单人购买)
限时优惠价:8月31日前报名参加课程可享受优惠价1980元/人(单人购买),转发朋友圈集赞超过28个赞,可享受优惠价1780元/人(单人购买)


5. 报名流程及付款方式


(1)随到随学,预约制报名。考虑到实验室承载能力有限,采用预约制,目前实验室对外开放10个学习名额。
(2)报名流程。报名可先扫描以下二维码添加樊衍孜微信(扫描以下二维码或添加微信号:19906719439),我们将与您电话沟通学习需求及目标,并出具学习计划及对应报价单。完成付款后,即可开始预约学习,随到随学。 
(3)关于发票。可开具能够报销的正式发票(如:技术服务费及培训费等)。支持预存,可以现场刷公务卡或银行卡转账,学习期间谢绝录像及录音。
电话咨询:0571-2883 4398(请按3号键)
微信咨询:199 0671 9439
邮箱咨询:fanyanzi@brainimaging.cn
实验室地址:浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼6楼602室


6. 更多学习方案敬请期待


以下训练营也将在近期陆续开营,每个训练营包含多名数据分析经验丰富的主讲老师的课程,他们将倾囊相授,帮助学员们掌握数据分析的核心技巧。训练营信息如下,敬请关注“脑影像工坊”公众号:

训练营-01:每课时低至38元 | 全年随到随学 | 静息态数据分析基础训练营 | RS02A点击此处跳转至RS02A训练营,主要内容包含:10套静息态数据分析课程,涵盖静息态功能磁共振基础入门,静息态指标计算(ALFF、fALFF、PerAF、Wavelet-ALFF、KCC-ReHo、Cohe-ReHo、DC、FC、GCA),盲反卷积、统计分析、多重比较校正、静息态文献解读、结果汇报图表制作及注意事项

训练营-02:全年随到随学|弥散张量成像(DTI)数据分析基础训练营|DT01A点击此处跳转至DT01A训练营,主要内容包含:DTI指标计算(FA、AD、RD、MD)与基于白质骨架的统计分析(TBSS)

训练营-03:全年随到随学|大脑复杂网络数据分析基础训练营|GT01A,主要内容包含:包含功能像数据的全局指标(小世界属性、网络效率、最短路径长度等)、节点指标(度中心、介数等)计算;基于个体形态学网络创建、全局指标(小世界属性、网络效率、最短路径长度等)、节点指标(度中心、介数等)计算等。包括理论+数据分析+案例实战。

训练营-04:全年随到随学|独立成分分析与网络间连接基础训练营(ICA+FNC)|IC01A,主要内容包含:包含GIFT工具包实操、ICASSO分析、降维、FNC讲解等。包括理论+数据分析+案例实战。

训练营-05:全年随到随学|弥散张量成像(DKI)数据分析基础训练营|DK01A,主要内容包含:包含DKI指标计算、纤维追踪等。包括理论+数据分析+案例实战。

训练营-06:全年随到随学|白质功能信号数据分析基础训练营|WM01A,主要内容包含:包含白质信号特殊预处理讲解、白质体素水平的局部指标计算、白质脑网络的构建、聚类方法讲解等。包括理论+数据分析+案例实战。

训练营-07:全年随到随学|基于大脑皮层的数据分析基础训练营|SF01A,主要内容包含:FreeSurfer基础操作,皮层指标(皮层厚度、曲率、沟深、皮层复杂度)等计算,FreeSurfer组水平分析等。包括理论+数据分析+案例实战。

训练营-08:全年随到随学|基于机器学习技术的脑影像数据分析基础训练营|ML01A,主要内容包含:包含支持向量机原理、特征空间、核函数讲解、交叉验证方法等讲解与实操。包括理论+数据分析+案例实战。

此外,还会陆续推出涵盖更多技术的训练营包含但不限于:
1)任务态数据分析:任务态激活分析、心理生理交互效应(PPI)、动态因果模型(DCM)、多体素模式分析(MVPA)......
2)元分析(META):基于AES-SDM的元分析、基于ALE的元分析......
3)定量磁化率成像(QSM):包含QSM图像的创建与标准化、QSM信号值的提取等
4)沿血管周围间隙弥散张量成像分析 (DTI-ALPS)
5)基于组水平结构网络分析:包含组水平结构网络的创建、全局指标、节点指标计算,网络攻击性分析、HUB节点识别等
6)深度学习在脑影像数据中的应用(如生成对抗网络、强化学习、迁移学习等)
......
如有其他想要学习的内容,欢迎添加樊衍孜的微信反馈(微信号:19906719439),我们将研发新的学习方案。





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