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第5期小班:任务态、DTI、ICA、FNC、脑影像Meta等数据分析培训

发布:2020-08-14    浏览:68 次




5期小班:任务态、DTI、ICA、

FNC、脑影像Meta等数据分析培训


2020.09.15-2020.09.20(周二~周日)

主办单位:杭州脑海科技有限公司

协办单位:杭州师范大学心理科学研究院

                  杭州拾睿科技有限公司


1. 简要说明



1) 本期培训班在杭州举办为期6天(9月15日-9月20日)

2) 内容涵盖:

  • 任务态fMRI数据分析原理及操作

  • 独立成分分析(ICA)原理及操作

  • FNC分析原理及操作

  • 脑影像Meta,包括SDM、ALE的原理及操作

  • 静息态fMRI数据分析(FCD、PerAF、ReHo等)

  • 弥散张量成像(DTI)数据分析原理及操作

3) 根据我们的经验,完全的零基础连续学习6天会比较累,零基础可以考虑参加我们的零基础精品班(限额3-9人)


第10期精品班(2020.08.28-2020.08.30(点击这里预览课程详情)

第11期精品班(2020.09.04-2020.09.06(点击这里预览课程详情)



2. 培训简介


      近年来随着技术的不断发展,脑科学引起越来越多研究者的兴趣。磁共振作为一种安全无创的研究工具,已逐渐被广泛应用于神经、精神、消化、认知等医学和心理学领域,用于探索大脑发育、老化、情绪加工、运动障碍及记忆巩固等机制。通过分析磁共振影像数据,我们可以从不同角度去研究大脑结构及功能,并发表SCI文章。因此掌握磁共振数据处理技术变得越来越重要。

      本期培训课程同时涵盖静息态数据分析、任务态数据分析以及弥散张量成像数据分析。我们不仅讲解低频振幅(ALFF)、局部一致性(ReHo)、基于图论的度中心度(DC)、功能连接(FC)等简单指标,还加入了独立成分分析(ICA)以及FNC网络构建及分析方法。除了静息态数据分析外,我们还设置了任务态数据分析以及弥散张量成像数据分析(DTI)。

      以往培训班,会有一些学员自己没有数据但又有发表SCI文章的需求,因此本期特别增加了基于脑影像的Meta分析课程,系统的讲解如何对已发表的脑影像文章进行Meta分析及发表SCI文章。

      除了方法学外,本期培训班还详细的介绍了统计检验、多重比较校正、多种脑图制作工具以及各种脑科学实用工具。

      为了让学员全面掌握以上技术并快速开展相应技术应用,我们的课程设计上不仅介绍理论,更注重实践操作。培训班内容丰富充实,并配备充足的助教,希望通过此次培训,能帮助到广大临床医生及科研工作者熟练掌握脑影像数据处理技能,从而在研究道路走的更远。


3. 内容安排与特色


本期内容包括:

1)任务态功能磁共振预处理及激活分析

2)基于脑影像的Meta分析从入门到进阶

3)静息态功能磁共振数据预处理技术

4)局部一致性(ReHo)低频振幅(ALFF)、比率低频振幅(fALFF)、度中心度(Degree centrality)、功能连接(Functionalconnectivity)等方法

5)弥散张量成像(DTI)数据分析

6)独立成分分析(ICA)原理及数据分析技术

7)FNC网络构建及分析

8)统计检验、多重比较校正、作图、实用脑科学工具

 

注:如果方便,请提前一天到会场20200914日(13:30 - 20:00)安装软件、熟悉场地、拷贝资料等。


4. 课程安排

9月

15日

周二

上午

贾熙泽

9:00-11:00

  • 静息态fMRI基本原理

  • 任务态fMRI基本原理

臧玉峰

11:00-12:00

  • 静息态功能磁共振概述及其

在认知与脑疾病的应用前景

下午

贾熙泽

14:00-17:00

  • 任务态fMRI预处理

  • block设计的数据分析

  • event-related设计的数据分析

  • 任务态数据结果呈现

9月

16日

周三

上午

袁丽霞

9:00-12:00

  • ICA算法介绍以及其原理

  • ICA在fMRI中的应用介绍

下午

袁丽霞

14:00-17:00

  • PCA算法原理及数据分析介绍

  • Group ICA介绍及操作

  • ICASSO介绍与使用

  • 结果的呈现与统计分析

晚上

黄国峰

18:30-21:30

  • Linux虚拟机的安装与使用

  • Linux操作基础及介绍

  • Linux常见命令练习

9月

17日

周四

上午

吕亚婷

9:00-12:00

  • DTI基础原理

  • DTI数据分析基本流程与FSL介绍

下午

吕亚婷

14:00-17:00

  • TBSS分析方法介绍

  • TBSS数据分析实操及结果呈现

9月

18日

周五

上午

袁丽霞

9:00-12:00

  • FNC的分析原理

  • FNC在脑疾病中的应用介绍

下午

袁丽霞

14:00-17:00

  • FNC的步骤详解

  • FNC的网络构建及统计分析

  • FNC的结果呈现

晚上

向安峰

18:30-21:30

  • 脑影像Meta分析的概念及原理

  • 脑影像Meta分析的软件介绍

  • Meta分析的操作流程

9月

19日

周六

上午

向安峰

9:00-12:00

  • Meta分析相关数据库的介绍与使用

  • Meta分析的文献检索

  • 基于SDM的脑影像Meta分析操作入门

下午

向安峰

14:00-17:00       

  • 基于SDM的脑影像Meta操作进阶

  • 脑影像Meta分析的分析报告撰写思路

晚上

向安峰

18:30-21:30

  • ALE脑影像分析操作精析与练习

  • ALE脑影像分析的注意事项及答疑

9月

20日

周日

上午

贾熙泽

9:00-12:00

  • 静息态fMRI预处理原理

  • ALFF、fALFF、PerAF原理及实操

  • Functional connectivity原理介绍及实操

  • FCD及ReHo原理介绍及实操

下午

贾熙泽

14:00-17:00

  • 静息态数据统计分析

  • 静息态数据结果与临床指标做相关

  • 结果呈现


备注:请各位学员自带笔记本电脑,建议电脑配置:windows 64位系统、4G以上内存、60G以上剩余硬盘空间。请尽量携带Windows电脑,如果只能使用苹果MAC电脑,请提前使用Bootcmap安装windows 64位系统


5. 授课老师


臧玉峰:医学博士。杭州师范大学心理科学研究院执行院长。1984年于河北医学院获医学学士学位、1991年于天津医学院获神经外科学硕士学位、2002年于北京大学精神卫生研究所获儿童精神卫生博士学位。曾经从事临床神经外科工作14年,之后在中科院自动化所模式识别国家重点实验室、北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室以及杭州师范大学工作。近年来主要从事静息态功能磁共振影像的计算方法学及其在认知与脑疾病的应用研究。与同事提出“局部一致性”和“低频振幅”等方法。带领研究团队开发了REST、DPARSF、RESTplus等软件。合作发表英语论文100多篇,Google Scholar数据库引用21319次(h指数64)。2014到2018年连续5年入选Elsevier“中国高被引学者”(神经科学),2017、2018年入选Clarivate 高被引学者(神经与行为科学)。

 

吕亚婷:博士,现任杭州师范大学认知与脑疾病研究中心臧玉峰教授课题组担任副研究员,硕士毕业于中国科学院自动化研究所模式识别与智能系统国家重点实验室,2013年博士毕业于德国马克思普朗克人类认知与脑科学研究所。共发表SCI论文21篇。其中,以第一或通讯作者(含共同)在Annals of Neurology、Journal of Neurology、Human Brain Mapping等权威期刊发表SCI论文11篇。申报人研究成果具有较高的临床应用价值,得到了多个项目支持,目前主持1项科技部国家重大慢性非传染性疾病重点研发计划课题,2项国家自然科学基金项目及1项杭州市创业创新项目,共计取得科研经费近200万。目前担任国内神经科学顶级期刊Neuroscience Bulletin(影响因子4.246)的青年编委;Frontiers in Neuroscience的Review Editor;并担任Neuroimage, Neuroimage: Clinical, Science Bulletin, Frontiers系列等国内外刊物的审稿人。

 

向安峰:上海中医药大学优秀博士论文获得者。研究方向为针灸调节疼痛的有效性评价和相关的神经生物学机制。主持校级创新课题一项,参与国自然国际(地区)合作交流、面上项目和上海市自然基金各一项。擅长包括脑功能影像在内的多种meta分析、静息态脑功能影像研究、动物行为、免疫荧光、多通道电生理和定位微量给药等。在跨物种与跨尺度的研究方面有较为丰富的经验。以第一作者表学术论文6篇(5篇SCI和1篇CSCD)和参编英文论著1部,代表性著作的年平均总引用过10,另有多篇SCI论文正在接受评审。曾获得全国博士论坛二等奖和国家奖学金等。曾多次承担Brain Imaging and Behavior、eCAM等期刊的审稿工作。

 

袁丽霞:毕业于浙江大学生物医学工程专业,获工学博士学位,现为杭州师范大学助理研究员。博士前期师从杜一平老师学习磁共振物理、序列设计和数据分析,后期跟随臧玉峰老师学习功能磁共振,并探索适用于功能磁共振的数据分析方法。目前主要的研究方向是多回波功能磁共振数据分析。曾以第一作者发表SCI文章2篇。

 

贾熙泽:杭州师范大学助理研究员,臧玉峰教授课题组成员,杭州脑海科技有限公司创始人。具有计算机、心理学及神经科学交叉背景。具有7年的磁共振数据分析经验,RESTplus的作者。静息态功能磁共振论坛(http://www.restfmri.net)管理员。主要研究方向为静息态功能磁共振方法学、数据分析软件开发。合作发表SCI文章14篇,其中主要作者5篇(第一作者或通讯作者)。Frontiers in Neuroscience杂志的Review Editor,Scientificreport等杂志的审稿人,曾多次受邀在国内外重要学术会议介绍静息态磁共振数据分析,其中包括:Fifth Biennial Conference on Resting State / Brain Connectivity(Vienna) 等。


6. 培训说明


      培训班限额招生,报满截止。我们会按照缴费顺序安排座位,为方便会务安排,报名敬请从速。考虑到疫情原因,本次培训每名学员每天发1个口罩。学员需要提供杭州健康码(支付宝首页搜索‘杭州健康码’)。


7. 培训费用


      费用包括培训费、资料费、培训期间提供快餐、饮品以及点心,交通及住宿费用自理,每人3500元。本培训班开具可以报销的正式发票。可以现场刷公务卡,培训期间谢绝录像。可以银行卡转账或支付宝付款,支付宝账号:19941364880,杨会云


8. 培训地点


      培训地点:浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼1005室,脑海科技第2会议室。


9. 报名方式


      请将报名回执以及缴费回执发送至srbrain@126.com,我们会联系您。


10. 联系方式


电话咨询:范蕊 133 6214 2709

微信咨询:范蕊 133 6214 2709


报名回执表

单位名称(发票抬头,纳税人识别号)


发票类型(会议费/培训费)


姓名


性别


电话号码


微信


科室/专业


研究方向


银行信息

户名:杭州脑海科技有限公司

账号:3301040160015883146

开户行:杭州银行萧山支行

汇款备注

第5期小班

11. 在线支持服务


       脑海科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持以及合作服务,确保学员能够熟练掌握脑影像数据处理的相关方法。



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2. 使用百度网盘下载:

链接:https://pan.baidu.com/s/1ZU1VJNJQ8V49vExcT9_WZQ

提取码:tqvn


3. 请加微信:133 6214 2709 索取word文档。


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08.28-08.30 第10期功能磁共振数据分析精品班

09.04-09.06  第11期功能磁共振数据分析精品班

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