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第6期小班:功能磁共振数据分析培训(零基础)

发布:2020-09-06    浏览:79 次



第6期小班:功能磁共振数据分析培训

(零基础)


2020.10.01-2020.10.06(周四~下周二)

主办单位:杭州脑海科技有限公司

协办单位:杭州师范大学心理科学研究院

                  杭州拾睿科技有限公司


1. 简要说明


1) 本期培训班在杭州举办为期6天(10月1日-10月6日)

2) 内容涵盖:

  • 任务态block及event-related数据分析原理及操作

  • 任务态及静息态数据预处理原理及操作

  • ALFF、fALFF、PerAF、ReHo、Degree centrality、Functional connectivity等指标计算

  • 统计分析及多重比较校正

  • DTI数据分析(TBSS)

  • 基于坐标的Meta分析(ALE)及VBM分析

  • 结果呈现(图以及表的制作)

3)本课程适合零基础学员


2. 课程说明


      近年来随着技术的不断发展,脑科学引起越来越多研究者的兴趣。磁共振作为一种安全无创的研究工具,已逐渐被广泛应用于神经、精神、消化、认知等医学和心理学领域,用于探索大脑发育、老化、情绪加工、运动障碍及记忆巩固等机制。通过分析磁共振影像数据,我们可以从不同角度去研究大脑结构及功能,并发表SCI文章。因此掌握磁共振数据处理技术变得越来越重要。

      经过不断的探索,脑海科技的数据分析培训班的课程设计也越来越成熟,培训效果也在不断提升,每次设计课程时,我们都需要反复权衡不同学员的基础与需求,但终究无法兼顾所有人,为了进一步方便大家学习,我们专门推出了为期6天的零基础入门班,通过手把手指导分析数据,协助急需掌握数据分析的临床医生以及科研工作者快速掌握功能磁共振数据分析技术。希望我们的培训班可以最大程度的满足零基础学员的快速掌握数据分析重要原理及相应技术的需求。考虑到疫情原因,本次培训每名学员每天发1个口罩。需要提供杭州健康码(均可在支付宝申请)

      注:请提前一天到会场2020年9月30日(13:30 - 20:00)安装软件、熟悉场地、拷贝资料等。


3. 课程安排


10

01

贾熙泽

9:00-10:00

  • 课程总论以及重要概念介绍

臧玉峰

10:00-12:00

  • 静息态功能磁共振概述及其在认知与脑疾病的应用前景

张韬

14:00-17:00

  • 功能磁共振软件安装手把手

  • 数据整理以及归类

  • 数据格式转换及注意事项

10

02

贾熙泽

9:00-12:00

  • 任务态fMRI基础概念

  • 任务态fMRI预处理

  • block设计的数据分析

  • event-related设计的数据分析

  • 任务态数据结果呈现

张韬

14:00-17:00

  • 静息态数据预处理

  • 静息态数据质量控制

  • 静息态数据预处理常见报错原因

10

03

张韬

9:00-12:00

  • 振幅指标精析与介绍

  • ALFF计算与对应预处理

  • fALFF计算与对应预处理

  • PerAF计算以及对应预处理

张韬

14:00-17:00

  • ReHo计算以及对应预处理

  • Degree centrality计算以及对应预处理

  • 功能连接计算以及注意事项

10

04

张韬

9:00-12:00

  • 单样本T检验

  • 双样本T检验

  • 配对样本T检验

张韬

14:00-17:00

  • 图片呈现(REST Viewer)

  • 脑区汇报以及表格制作

  • MASK制作以及使用

  • 脑成像数据与临床量表的结合分析

黄国峰

19:00-21:00

  • linux介绍以及入门

10

05

吕亚婷

9:00-12:00

  • DTI基础原理

  • DIT数据分析基本流程以及FSL初步使用

吕亚婷

14:00-17:00       

  • TBSS分析方法介绍

  • TBSS数据分析实操以及结果呈现

10

06

贾熙泽

9:00-12:00

  • 脑影像的Meta分析介绍

  • ALE算法原理

  • ALE分析软件实操练习

贾熙泽

14:00-17:00

  • VBM原理及介绍

  • VBM分析及实操

  • 静息态项目实战及临床应用介绍



备注:请各位学员自带笔记本电脑,建议电脑配置:windows 64位系统、4G以上内存、60G以上剩余硬盘空间。请尽量携带Windows电脑,如果只能使用苹果MAC电脑,请提前使用Bootcmap安装windows 64位系统


4. 授课老师


臧玉峰:医学博士。杭州师范大学心理科学研究院执行院长。1984年于河北医学院获医学学士学位、1991年于天津医学院获神经外科学硕士学位、2002年于北京大学精神卫生研究所获儿童精神卫生博士学位。曾经从事临床神经外科工作14年,之后在中科院自动化所模式识别国家重点实验室、北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室以及杭州师范大学工作。近年来主要从事静息态功能磁共振影像的计算方法学及其在认知与脑疾病的应用研究。与同事提出“局部一致性”和“低频振幅”等方法。带领研究团队开发了REST、DPARSF、RESTplus等软件。合作发表英语论文100多篇,Google Scholar数据库引用21319次(h指数64)。2014到2018年连续5年入选Elsevier“中国高被引学者”(神经科学),2017、2018年入选Clarivate 高被引学者(神经与行为科学)。

 

吕亚婷:博士,现任杭州师范大学认知与脑疾病研究中心臧玉峰教授课题组担任副研究员,硕士毕业于中国科学院自动化研究所模式识别与智能系统国家重点实验室,2013年博士毕业于德国马克思普朗克人类认知与脑科学研究所。共发表SCI论文21篇。其中,以第一或通讯作者(含共同)在Annals of Neurology、Journal of Neurology、Human Brain Mapping等权威期刊发表SCI论文11篇。申报人研究成果具有较高的临床应用价值,得到了多个项目支持,目前主持1项科技部国家重大慢性非传染性疾病重点研发计划课题,2项国家自然科学基金项目及1项杭州市创业创新项目,共计取得科研经费近200万。目前担任国内神经科学顶级期刊Neuroscience Bulletin(影响因子4.246)的青年编委;Frontiers in Neuroscience的Review Editor;并担任Neuroimage, Neuroimage: Clinical, Science Bulletin, Frontiers系列等国内外刊物的审稿人。


贾熙泽:杭州师范大学助理研究员,臧玉峰教授课题组成员,杭州脑海科技有限公司创始人。具有计算机、心理学及神经科学交叉背景。具有7年的磁共振数据分析经验,RESTplus的作者。静息态功能磁共振论坛(http://www.restfmri.net)管理员。主要研究方向为静息态功能磁共振方法学、数据分析软件开发。合作发表SCI文章14篇,其中主要作者5篇(第一作者或通讯作者)。Frontiers in Neuroscience杂志的Review Editor,Scientificreport等杂志的审稿人,曾多次受邀在国内外重要学术会议介绍静息态磁共振数据分析,其中包括:Fifth Biennial Conference on Resting State / Brain Connectivity(Vienna) 等。


5. 培训说明


      培训班限额招生,报满截止。我们会按照缴费顺序安排座位,为方便会务安排,报名敬请从速。考虑到疫情原因,本次培训每名学员每天发1个口罩。学员需要提供杭州健康码(支付宝首页搜索‘杭州健康码’)。


6. 培训费用


      费用包括培训费、资料费、培训期间提供快餐、饮品以及点心,交通及住宿费用自理,每人3500元。本培训班开具可以报销的正式发票。可以现场刷公务卡,培训期间谢绝录像。可以银行卡转账或支付宝付款,支付宝账号:19941364880,杨会云


7. 培训地点


      培训地点:浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼1005室,脑海科技第2会议室。


8. 报名方式


      请将报名回执以及缴费回执发送至srbrain@126.com,我们会联系您。


9. 联系方式


电话咨询:黄国峰 180 7298 0399

微信咨询:黄国峰 180 7298 0399


报名回执表

单位名称(发票抬头,纳税人识别号)


发票类型(会议费/培训费)


姓名


性别


电话号码


微信


科室/专业


研究方向


银行信息

户名:杭州脑海科技有限公司

账号:3301040160015883146

开户行:杭州银行萧山支行

汇款备注

第6期小班

10. 在线支持服务


       脑海科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持以及合作服务,确保学员能够熟练掌握脑影像数据处理的相关方法。



获取word版本


1. 点击阅读全文,或扫描二维码


2. 使用百度网盘下载:

链接:https://pan.baidu.com/s/19JriRPjKfBePnWMxOY3sfw

提取码:6fgc


3. 请加微信:180 7298 0399 索取word文档。



如果您有一定基础,欢迎参加 9月15日 - 9月20日的第5期小班,内容涵盖:任务态、DTI、ICA、FNC、脑影像Meta等(点击此处查看详情)

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