数据导入
西门子、飞利浦、联影、GE…发布:2020-11-06 浏览:306 次
第10期小班:多模态磁共振数据分析手把手培训班
(零基础)
2020.12.15-2020.12.20(周二~周日)
主办单位:杭州脑海科技有限公司
协办单位:杭州师范大学心理科学研究院
杭州拾睿科技有限公司
1. 内容概括
1) 本期培训班在杭州举办为期6天(12月15日-12月20日)
2) 内容涵盖:
任务态block及event-related数据分析原理及操作
ALFF、fALFF、PerAF、ReHo、FCD、FCS、Functional connectivity等指标计算
格兰杰因果分析(GCA)原理及操作
DTI数据分析(TBSS等)
结果呈现(图以及表的制作)
基于坐标的Meta分析(ALE)
独立成分分析(ICA)
基于体素的形态学分析(VBM)
T检验、单因素ANOVA以及双因素的ANOVA分析
多重比较校正原理及操作(FWE、FDR、GRF、AlphaSim以及TFCE等)
3)本课程为基础班,适合零基础学员
对DTI、DKI等技术感兴趣的朋友欢迎参加我们的第9期结构数据分析小班:
11月24日-11月29日,第9期小班:DTI、DKI、TBSS、基于白质纤维的网络构建以及VBM等(点击此处查看详情)
2. 课程说明
经过近2年的研发,我们对课程进行了再一次重要升级,重新设置安排了课程体系,尽可能让学员在6天内可以掌握更多的内容。近年来随着技术的不断发展,脑科学引起越来越多研究者的兴趣。目前磁共振已逐渐被广泛应用于神经、精神、消化、认知等医学和心理学领域,用于探索大脑发育、老化、情绪加工、运动障碍及记忆巩固等机制。掌握磁共振数据处理技术变得越来越重要。
对于零基础的学员,本课程几乎涵盖了所有适合基础学员掌握的技术,课程内容覆盖多模态技术,包括:任务态、静息态、结构像(形态学分析及DTI)。对于已有数据的学员可以快速上手分析数据,对于没有数据的学员也可以尝试Meta分析。数据分析指标涵盖:常见的局部指标、基于图论的FCD及FCS、基于种子点功能连接、独立成分分析(ICA),统计模块不仅包含T检验,还包括双因素方差分析,多重比较校正涵盖常用的所有校正方法。
本课程为期6天,课程设计环环相扣,为确保大家在6天内可以充分的掌握内容,我们承诺:每期都会根据学员人数安排充足的助教,保证手把手指导分析数据(注:脑海科技团队一共拥有10余人的助教)。确保急需掌握数据分析的临床医生以及科研工作者在6天快速掌握需要的数据分析技术。希望我们的培训班可以最大程度的满足零基础学员的快速掌握数据分析重要原理及相应技术的需求。
注:请提前一天到会场2020年12月14日(13:30 - 20:00)安装软件、熟悉场地、拷贝资料等。
3. 课程安排
12月 15日 周二 | 上午 | 课程总论及概述 | 贾熙泽 | 课程总论以及重要概念介绍 |
臧玉峰 | 静息态功能磁共振概述及其在认知与脑疾病的应用前景 | |||
下午 | 基础概念及数据整理 | 张韬 | 功能磁共振软件安装手把手 | |
数据整理以及归类 | ||||
数据格式转换及注意事项 | ||||
基础概念介绍及解析 | ||||
晚上 | 编程入门 | 黄国峰 | MATLAB编程入门 | |
12月 16日 周三 | 上午 | 任务态原理及数据分析实操 | 贾熙泽 | 任务态fMRI基础概念 |
任务态fMRI预处理 | ||||
block设计的数据分析 | ||||
event-related设计的数据分析 | ||||
任务态数据结果呈现 | ||||
下午 | 静息态预处理及常见报错 | 张韬 | 静息态数据预处理 | |
静息态数据质量控制 | ||||
静息态数据预处理常见报错原因 | ||||
晚上 | 静息态局部指标原理及计算 | 张韬 | ALFF、fALFF、PerAF原理及操作 | |
ReHo原理及操作 | ||||
12月 17日 周四 | 上午 | T检验及多重比较校正 | 张韬 | 单样本T检验 |
双样本T检验 | ||||
配对样本T检验 | ||||
多重比较校正介绍 | ||||
FDR、FWE原理及实操 | ||||
GRF、AlphaSim原理及实操 | ||||
TFCE原理及实操 | ||||
下午 | 方差分析 | 张韬 | 单因素方差分析(多组) | |
单因素方差分析(重复测量) | ||||
2*2设计的方差分析 | ||||
双因素方差分析 | ||||
多重比较矫正 | ||||
晚上 | Linux | 黄国峰 | Linux常用命令介绍 | |
Linux上机实操以及虚拟机使用 | ||||
12月 18日 周五 | 上午 | DTI基础 | 吕亚婷 | DTI基础原理 |
DTI数据分析基本流程及FSL初步使用 | ||||
FA、MD、AD、RD指标计算 | ||||
下午 | TBSS原理及实操 | 吕亚婷 | TBSS数据分析方法介绍 | |
TBSS数据分析方法实操 | ||||
结果呈现 | ||||
统计分析 | ||||
晚上 | GCA原理及实操 | 孙家伟 | GCA原理入门 | |
GCA实操与数据分析 | ||||
12月 19日 周六 | 上午 | 功能连接及FCD、FCS | 张韬 | 基于种子点功能连接原理介绍 |
FCD、FCS原理及实操 | ||||
下午 | 独立成分分析(1) | 张韬 | 独立成分分析原理 | |
ICA成分数的选择 | ||||
关于ICA成分的挑选 | ||||
使用GIFT实操分析ICA | ||||
晚上 | 独立成分分析(2) | 张韬 | ICA结果统计分析 | |
ICA结果呈现 | ||||
12月 20日 周日 | 上午 | 基于体素的形态学分析 | 张韬 | VBM原理介绍 |
VBM实操计算 | ||||
VBM结合静息态指标 | ||||
VBM与临床指标的相关分析 | ||||
下午 | 多模态数据分析 | 贾熙泽 | 基于ALE的Meta分析 | |
局部指标+网络指标联合分析 | ||||
静息态+VBM+DTI的多模态分析详解 | ||||
作图进阶以及BrainNet的使用 |
备注:请各位学员自带笔记本电脑,建议电脑配置:windows 64位系统、8G以上内存、80G以上剩余硬盘空间。请尽量携带Windows电脑,如果只能使用苹果MAC电脑,请提前使用Bootcmap安装windows 64位系统。
4. 授课老师
臧玉峰:医学博士。杭州师范大学心理科学研究院执行院长。1984年于河北医学院获医学学士学位、1991年于天津医学院获神经外科学硕士学位、2002年于北京大学精神卫生研究所获儿童精神卫生博士学位。曾经从事临床神经外科工作14年,之后在中科院自动化所模式识别国家重点实验室、北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室以及杭州师范大学工作。近年来主要从事静息态功能磁共振影像的计算方法学及其在认知与脑疾病的应用研究。与同事提出“局部一致性”和“低频振幅”等方法。带领研究团队开发了REST、DPARSF、RESTplus等软件。合作发表英语论文100多篇,Google Scholar数据库引用21319次(h指数64)。2014到2018年连续5年入选Elsevier“中国高被引学者”(神经科学),2017、2018年入选Clarivate 高被引学者(神经与行为科学)。
吕亚婷:博士,现任杭州师范大学认知与脑疾病研究中心臧玉峰教授课题组担任副研究员,硕士毕业于中国科学院自动化研究所模式识别与智能系统国家重点实验室,2013年博士毕业于德国马克思普朗克人类认知与脑科学研究所。共发表SCI论文21篇。其中,以第一或通讯作者(含共同)在Annals of Neurology、Journal of Neurology、Human Brain Mapping等权威期刊发表SCI论文11篇。申报人研究成果具有较高的临床应用价值,得到了多个项目支持,目前主持1项科技部国家重大慢性非传染性疾病重点研发计划课题,2项国家自然科学基金项目及1项杭州市创业创新项目,共计取得科研经费近200万。目前担任国内神经科学顶级期刊Neuroscience Bulletin(影响因子4.246)的青年编委;Frontiers in Neuroscience的Review Editor;并担任Neuroimage, Neuroimage: Clinical, Science Bulletin, Frontiers系列等国内外刊物的审稿人。
贾熙泽:杭州脑海科技有限公司首席执行官,杭州师范大学认知与脑疾病研究中心臧玉峰教授课题组担任助理研究员,中国心理学会积极心理学专委会理事。目前主持国自然青年基金项目1项,并作为主要参与人参与多项国自然科学基金项目。具有计算机、心理学及神经科学交叉背景。主要研究方向为静息态功能磁共振方法学、脑影像Meta分析以及静息态数据分析软件开发。2013年起负责维护REST系列工具包,并开发了RESTplus,该软件的论文目前已发表于Science Bulletin(影响因子 9.5分)。静息态功能磁共振论坛(http://www.restfmri.net)管理员。合作发表SCI文章14篇(引用91次),其中主要作者5篇(第一作者或通讯作者)。Frontiers in Neuroscience(SCI医学2区,3年平均IF 3.69)、Frontiers in Psychology(SSCI心理学2区期刊,IF 2.0)以及Frontiers in Psychiatry(SCI医学3区,3年平均IF 3.18)杂志的评审编辑,Journal of Magnetic Resonance Imaging、Neural Plasticity、Scientific report等多个杂志的审稿人,曾多次受邀在国内外重要学术会议介绍静息态磁共振数据分析。
张韬:脑海科技高级数据分析工程师
黄国峰:脑海科技高级数据分析工程师
5. 培训说明
培训班限额招生20人。我们会按照缴费顺序安排座位,为方便会务安排,报名敬请从速。考虑到疫情原因,本次培训每名学员每天发1个口罩。学员需要提供杭州健康码(支付宝首页搜索‘杭州健康码’)。
6. 培训费用
费用包括培训费、资料费、培训期间提供快餐、饮品以及点心,交通及住宿费用自理,每人3500元。本培训班开具可以报销的正式发票。可以现场刷公务卡,培训期间谢绝录像。可以银行卡转账或支付宝付款,支付宝账号:19941364880,杨会云。
7. 培训地点
培训地点:浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼10楼,脑海科技第3会议室。
8. 报名方式
请将报名回执以及缴费回执发送至srbrain@126.com,我们会联系您。
9. 联系方式
电话咨询:黄国峰 180 7298 0399
微信咨询:黄国峰 180 7298 0399
报名回执表
单位名称(发票抬头,纳税人识别号) | |
发票类型(会议费/培训费) | |
姓名 | |
性别 | |
电话号码 | |
微信 | |
科室/专业 | |
研究方向 | |
银行信息 | 户名:杭州脑海科技有限公司 账号:3301040160015883146 开户行:杭州银行萧山支行 |
汇款备注 | 第10期小班 |
10. 在线支持服务
脑海科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持以及合作服务,确保学员能够熟练掌握脑影像数据处理的相关方法。
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2. 使用百度网盘下载:
链接:https://pan.baidu.com/s/1O23mmG_3yPCSKorCxjDeNg
提取码:zmcr
3. 请加微信:180 7298 0399 索取word文档。
其他培训班:
11月24日-11月29日,第9期小班:DTI、DKI、TBSS、基于白质纤维的网络构建以及VBM等(点击此处查看详情)