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第28期小班:弥散张量成像(DTI)指标及纤维追踪专题培训

发布:2021-05-30    浏览:83 次


第28期小班:弥散张量成像(DTI)指标及纤维追踪专题培训 



2021.08.24-2021.08.29(周二~周日)

主办单位:杭州脑海科技有限公司

协办单位:杭州师范大学心理科学研究院

                  杭州拾睿科技有限公司


1. 简要说明


1) 本期培训班在杭州举办为期6天(8月24日-8月29日)

2) 内容涵盖:

  • DKI原理及参数解读

  • DKI计算及TBSS实操

  • 纤维追踪及脑白质网络的原理及介绍

  • 脑网络节点定义及确定性纤维追踪实操

  • 确定性网络构建

  • BedPosX、概率性纤维追踪实操及网络构建

  • 基于体素的形态学分析

  • 统计分析、多重比较校正及作图


2. 课程说明


弥散张量成像(DTI),是一种无侵入性的活体大脑结构成像技术,该技术可以通过检测水分子在大脑不同区域内的扩散特性,从而无创的评估大脑的白质纤维束走向信息。近年来,越来越多的研究中使用DTI技术,国内的许多研究表明弥散张量成像对阿尔茨海默病、慢性中风、抑郁症、癫痫以及精神分裂症等疾病的病理特异性研究起到了非常重要的作用。对于纤维束的研究,可能为脑疾病的早期诊断提供有效的技术手段。
为了协助大家更快速的了解弥散张量成像的相关技术,我们拟举办一期弥散张量成像技术的专题培训,内容涵盖弥散张量成像(DTI)的指标计算、纤维追踪分析、确定性纤维追踪以及概率性纤维追踪的确网络构建,此外我们还增加了DKI技术原理及数据分析操作。本次培训邀请了PANDA软件的作者仲苏玉博士讲授DTI追踪相关技术,张嘉颖博士讲授DKI相关技术课程为期6天,为确保大家在6天内可以充分的掌握内容,我们承诺:每期都会根据学员人数安排充足的助教,保证手把手指导分析数据(注:脑海科技团队一共拥有10余人的助教)。课程涵盖理论+实操+复习+总结,相信大家一定可以在6天系统的培训中受益匪浅!
注:请提前一天到会场2021年08月23日(13:30 - 20:00)安装软件、熟悉场地、拷贝资料等。

3. 课程安排

第1天

08.24

周二


臧玉峰
张韬

[上午]

课程概论

9:00 - 12:00

静息态、任务态及相关技术概述

DTI数据整理及图像初识

贾熙泽

[下午]

多模态数据采集

14:00 -17:00

课程体系介绍

多模态数据采集注意事项

关于多重比较校正

黄国峰

[晚上]

Linux入门

18:00 - 21:30

Linux基础命令

Linux的上机实操

第2天

08.25

周三


张嘉颖

[上午]

扩散磁共振成像原理及质量控制

9:00 - 12:00

爱因斯坦公式、扩散现象和扩散磁共振成像

扩散磁共振图像常见问题及质量控制

张嘉颖

[下午]

DTI数据分析及实操

14:00 -17:00

扩散磁共振成像预处理及相关进展

DTI技术原理和计算(含操作)

李仔麒

[晚上]

答疑与实操复习

18:00 - 19:20

自由练习与问题答疑

19:30 - 21:30

实操复习白天内容

第3天

08.26

周四


张嘉颖

[上午]

DKI原理及参数解读

9:00 - 12:00

DKI技术原理

DKI图像采集

DKI参数估计和参数意义

张嘉颖

[下午]

DKI计算及TBSS实操

14:00 -17:00

DKI计算(含实操)

扩散磁共振成像TBSS简介和结果呈现(含实操)

张韬

[晚上]

答疑与实操复习

18:00 - 19:20

自由练习与问题答疑

19:30 - 21:30

实操复习白天内容

第4天

08.27

周五

张韬

[上午]

基于体素的形态学分析

9:00 - 12:00

基于体素的形态学分析:原理及应用

横向数据以及纵向数据的形态学分析方法

CAT12软件应用及形态学指标计算

形态学指标与临床指标的相关性分析

张韬

[下午]

统计分析与结果呈现

14:00 -17:00

一般线性模型介绍

SPM的二阶分析(T检验)

多重比较校正(FWE,FDR,GRF,Alphasim,TFCE)

图表制作(RESTplus Viewer,MRIcron)

李仔麒

[晚上]

复习及阶段性小节

18:00 - 19:20

自由练习与问题答疑

19:30 - 21:30

实操复习白天内容

课程阶段性总结与复习

第5天

08.28

周六


仲苏玉

[上午]

纤维追踪及脑白质网络的原理及介绍

9:00 - 12:00

确定性纤维追踪原理介绍及应用现状

概率性纤维追踪原理介绍及应用现状

脑白质网络原理介绍及应用现状

仲苏玉

[下午]

脑网络节点定义及确定性纤维追踪实操

14:00 -17:00

脑网络节点定义(上机操作)

基于DiffusionToolkit的确定性纤维追踪(上机操作)

张韬

[晚上]

答疑与实操复习

18:00 - 19:20

自由练习与问题答疑

19:30 - 21:30

实操复习白天内容

第6天

08.29

周日




仲苏玉

[上午]

确定性网络构建及BedPosX实操

9:00 - 12:00

确定性网络构建(上机操作;PANDA)

基于fsl的概率性纤维追踪的数据分析一:BedpostX(上机操作)

仲苏玉

[下午]

概率性纤维追踪实操及网络构建


14:00 -17:00

基于fsl的概率性纤维追踪的数据分析二:纤维追踪(上机操作)

概率性纤维追踪的结果介绍

概率性网络构建(上机操作)



备注:请各位学员自带笔记本电脑,建议电脑配置:windows 64位系统、8G以上内存、80G以上剩余硬盘空间。请尽量携带Windows电脑,如果只能使用苹果MAC电脑,请提前使用Bootcmap安装windows 64位系统


4. 讲师简介


臧玉峰医学博士,杭州师范大学心理科学研究院执行院长,杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心主任,浙江省认知障碍评估技术研究重点实验室主任。1984年于河北医学院获医学学士学位、1991年于天津医学院获神经外科学硕士学位(导师薛庆澄教授)、2002年于北京大学精神卫生研究所获精神病学博士学位(导师王玉凤教授)。曾经从事临床神经外科工作14年,2002年至今先后在中科院自动化所模式识别国家重点实验室、北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室以及杭州师范大学工作。主要从事静息态功能磁共振计算方法及其在认知与脑疾病的应用研究。提出“局一致性”和“低频振幅”等方法。带领研究团队开发了REST、DPARSF、REST-GCA、RESTplus等软件。合作发表论文100多篇,被引用>28,000次(谷歌学术),有5篇主要作者论文被引用1116-2366次。共同领导多个国际多中心静息态功能磁共振合作研究。2014到2020年连续7年入选Elsevier“中国高被引学者”(神经科学、心理学),2017、2018年入选Clarivate 高被引学者(神经与行为科学)。

 

仲苏玉:博士,现为北京邮电大学人工智能学院特聘副研究员。2016年6月于北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室获得博士学位;2016年6月至2020年8月期间,在北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室从事博士后工作。目前主持国家自然科学基金青年项目1项,完成博士后面上项目1项,并作为主要参与人参与多项国家自然科学基金项目。主要从事基于弥散磁共振成像的人脑白质连接组学的方法学及其应用研究。目前已在相关领域国际权威期刊共发表SCI论文21篇,其中包括以第一作者身份在Cerebral Cortex, Human Brain Mapping等期刊发表论文8篇,以共同作者的身份在the Journal of neuroscience等主流SCI期刊发表论文13篇。参与开发了“弥散磁共振人脑图像的并行处理平台”(软件著作权登记号:2011SR091748;主要开发者),该软件的相关论文目前已被引用150余次。PANDA软件工具包已在国际神经影像工具共享平台上(http://www.nitrc.org/projects/panda)被下载20000余次,被国内外同行广泛使用,得到了非常好的反馈和评价。

 

张嘉颖:北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室助理研究员。主要研究兴趣为1)人脑微观结构成像技术及其在正常及异常发育中的应用2)机器学习在扩散磁共振图像采集和处理的应用。曾在伦敦大学学院(University College London,UCL)计算机学院及医学图像计算中心的人脑微观结构成像领域国际领军人物Daniel Alexander课题组完成医学成像博士训练,并在伦敦国王大学生物工程学院婴幼儿成像与健康系进行一年博士后工作。博士期间,曾获得英国UCL工程学院院长奖和UCL国际研究生奖学金。张嘉颖博士近年来使用基于生物物理模型的新大脑微观结构成像技术,1)首次对神经退行性疾病如亨氏综合征、早发性阿尔兹海默症等发病前和发病后活体大脑白质病理进行了系统性横、纵向研究,与世界顶尖神经科学研究所UCL Institute of Neurology相关研究中心等展开了一系列合作;2)在动物模型中对早产儿脑白质损伤潜在药物的药效性评估。此外,她在优化临床图像数据分析方法如模型估计及设计适用于临床的图像采集序列等进行了方法学研究,且主导完成了Track-On HD、Treat-HD等临床项目中扩散磁共振成像图像质量监控,已在大脑微观结构成像领域积累了丰富的临床技术转化应用及体外动物模型研究经验。截止到目前,其已在Annals of Neurology、Neurobiology of Aging、NeuroImage等国际神经科学及影像学杂志发表共9篇原创性研究论文,国际医学影像顶级会议MICCAI论文1篇,2次受邀进行了国际磁共振年会大会报告,并为Neurobiology of Aging, Journal of Metabolism and Blood Flow,Frontier in Neuroscience等国际期刊审稿人。

 

贾熙泽:杭州脑海科技有限公司首席执行官,杭州师范大学助理研究员,中国心理学会积极心理学专委会委员,具有计算机、心理学及神经科学交叉背景。目前主持国自然青年基金项目1项,并作为主要参与人参与多项国自然科学基金项目。主要研究方向为静息态功能磁共振方法学、脑影像Meta分析以及静息态数据分析软件开发。2013年起负责维护REST系列工具包,并开发了RESTplus,该软件的论文目前已发表于Science Bulletin (影响因子9.5分)。静息态功能磁共振论坛(http://www.restfmri.net)管理员。合作发表SCI文章21篇,其中主要作者11篇(第一作者或通讯作者)。Neural Plasticity杂志的guest editor,Frontiers in Neuroscience(SCI医学2区,3年平均 IF 3.69)、Frontiers in Psychology(SSCI心理学2区期刊,影响因子2.0)以及Frontiers in Psychiatry(SCI医学3区,3年平均IF 3.18)杂志的评审编辑,Journal of Magnetic Resonance Imaging、Frontiers Aging Neuroscience、Brain research、Scientific Report等多个杂志的审稿人,曾多次受邀在国内外重要学术会议介绍静息态磁共振数据分析。

 

张韬:脑海科技高级数据分析工程师

 

李仔麒:脑海科技高级数据分析工程师


黄国峰:脑海科技高级数据分析工程师


5. 培训说明


培训班限额招生20人,报满截止。我们会按照缴费顺序安排座位,为方便会务安排,报名敬请从速。考虑到疫情原因,本次培训每名学员每天发1个口罩。学员需要提供杭州健康码(支付宝首页搜索‘杭州健康码’)。


6. 培训费用


费用包括培训费、资料费、培训期间提供快餐、饮品以及点心,交通及住宿费用自理,每人3500元。本培训班开具可以报销的正式发票。可以现场刷公务卡,培训期间谢绝录像。可以银行卡转账或支付宝付款,支付宝账号:19941364880,杨会云

7. 培训地点


培训地点:浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼10楼,脑海科技第3会议室。

8. 报名方式


请将报名回执以及缴费回执发送至srbrain@126.com,我们会联系您。

9. 联系方式


电话咨询:黄国峰 180 7298 0399

微信咨询:黄国峰 180 7298 0399


报名回执表

单位名称(发票抬头)


纳税人识别号(税号)


发票类型(会议费/培训费)


姓名


性别


电话号码


微信


科室/专业


研究方向


银行信息

户名:杭州脑海科技有限公司

账号:3301040160015883146

开户行:杭州银行萧山支行

汇款备注

第28期小班

10. 在线支持服务


脑海科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持以及合作服务,确保学员能够熟练掌握脑影像数据处理的相关方法。


获取word版本


1. 扫描二维码

2. 使用百度网盘下载:

链接:https://pan.baidu.com/s/1Chva8plyl5qpfX4aWT1wGg

提取码:gg4b


3. 请加微信:180 7298 0399 索取word文档。


其它培训班:


零基础培训班可参加:

06月01日-06月06日,第21期小班:多模态磁共振数据分析手把手基础班(点击此处查看详情)

06月22日-06月27日,第22期小班:多模态磁共振数据分析手把手基础班(点击此处查看详情)


学习复杂网络可参加:

07月20日-07月25日,第24期小班:复杂网络相关指标理论及实操专题培训(点击此处查看详情)

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