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第29期:静息态及结构像数据分析基础班

发布:2021-05-31    浏览:71 次


第29期:静息态及结构像数据分析基础班



2021.08.31-2021.09.05(周二~周日)

主办单位:杭州脑海科技有限公司

协办单位:杭州师范大学心理科学研究院

                  杭州拾睿科技有限公司


1. 特色如下


1)课程时间充足,在杭州为期6天的系统培训(08月31日-09月05日)

2)通过合理的课程设计,为学员后续多模态数据分析打下坚实基础,内容涵盖:

功能:静息态MRI数据分析

  • 格兰杰因果分析(GCA)原理及操作

  • 独立成分分析(ICA)

  • 局部指标计算(如:ALFF、fALFF、PerAF、ReHo等)

  • FCD、FCS、Functional connectivity等指标计算

  • FNC分析原理及网络构建

结构:基于体素的形态学分析与弥散张量成像(DTI)

  • 基于体素的形态学分析:原理及应用

  • 横向数据以及纵向数据的形态学分析方法(CAT12)

  • DTI数据分析:FA、MD、AD、RD指标计算

  • DTI数据分析:TBSS原理及分析实操

3)基础课程设置合理扎实,内容包含:

A. 磁共振实验设计及数据采集注意事项

B.MRI数据分析指标在文章中的应用及常见问题

C. 基于坐标的Meta分析(ALE)

D. 统计分析(1):T检验、单因素ANOVA

E. 统计分析(2):多重比较校正原理及操作(FWE、FDR、GRF、AlphaSim以及TFCE等)

F. 多模态数据分析结果呈现(图以及表的制作)


2. 课程说明


近年来随着技术的不断发展,脑科学引起越来越多研究者的兴趣。目前磁共振已逐渐被广泛应用于神经、精神、消化、认知等医学和心理学领域,用于探索大脑发育、老化、情绪加工、运动障碍及记忆巩固等机制。掌握磁共振数据处理技术变得越来越重要。
本次课程内容相对基础,几乎涵盖了所有适合初学者掌握的静息态及结构像数据分析技术,对于已有数据的学员可以快速上手多模态数据分析,对于没有数据的学员也可以尝试Meta分析。
本课程为期6天,课程设计环环相扣,为确保大家在6天内可以充分的掌握内容,我们承诺:每期都会根据学员人数安排充足的助教,保证手把手指导分析数据注:脑海科技团队一共拥有10余人的助教)。确保急需掌握数据分析的临床医生以及科研工作者在6天快速掌握需要的数据分析技术。希望我们的培训班可以最大程度的满足零基础学员的快速掌握数据分析重要原理及相应技术的需求。

注:请提前一天到会场2021年08月30日(13:30 - 20:00)安装软件、熟悉场地、拷贝资料等。


3. 课程安排


第1天

8.31

周二







[上午]

基础概念、课程体系及数据初识

9:00 - 12:00

静息态功能磁共振基本概念

课程体系介绍

功能磁共振数据初识


[下午]

软件安装、数据整理及与预处理原理

14:00 -17:00

静息态功能磁共振软件安装

静息态功能磁共振数据整理实操

静息态数据预处理原理介绍






[晚上]

预处理实操及Linux入门

18:00 - 21:30

静息态数据预处理实操
静息态数据预处理常见报错解析

linux使用入门及实操

第2天

9.01

周三



[上午]

局部指标计算

9:00 - 12:00

局部指标基础概念

ALFF、fALFF以及PerAF指标原理

ReHo原理及实操

局部指标计算上机实操


[下午]

统计检验及多重比较校正

14:00 -17:00
统计检验理论+实操
多重比较校正介绍
FDR、FWE原理及实操
GRF、AlphaSim原理及实操

TFCE原理及实操



[晚上]

独立成分分析

18:00 - 21:30

独立成分分析(ICA)原理介绍
基于GIFT的ICA实操及参数讲解
ICA应用实例分析

ICA成分图绘制

第3天

9.02

周四


[上午]

FNC原理及脑疾病应用举例

9:00 - 12:00

FNC的分析原理介绍

FNC在脑疾病中的应用举例

[下午]

FNC实操上机

14:00 -17:00

FNC的计算步骤详解

FNC的网络构建及统计分析

FNC的结果呈现


[晚上]

CAT12:基于体素的形态学分析(VBM)

18:00 - 21:30

基于体素的形态学分析:原理及应用
横向数据以及纵向数据的形态学分析方法
CAT12软件的应用介绍以及形态学指标的计算
基于体素的形态学分析的统计方法介绍与实操

第4天

9.03

周五

[上午]

DTI数据分析入门

9:00 - 12:00

DTI基础原理

DTI数据分析操作基本流程及FSL初步使用

FA、MD、AD、RD指标计算

[下午]

DTI数据分析进阶

14:00 -17:00

TBSS数据分析原理介绍

TBSS数据分析步骤解读及实操

DTI数据分析结果呈现

DTI数据分析结果的统计分析


[晚上]

课程总结、复习及答疑

18:00 - 21:30

任务态数据分析小结、复习及答疑
静息态数据分析小结、复习及答疑

弥散张量成像数据分析小结、复习及答疑

第5天

9.04

周六



[上午]

功能连接及FCD、FCS

9:00 - 12:00

基于种子点功能连接原理介绍

FCD、FCS原理及实操

REST Viewer的使用及作图注意事项


[下午]

结果汇报及常用工具

14:00 -17:00

表格制作及脑区汇报注意事项

BrainNet:基于皮层的脑图制作
脑影像数据与临床指标的相关分析

实用小工具及相关使用



[晚上]

格兰杰因果分析(GCA)

18:00 - 21:30

GCA概念和原理介绍
Blind deconvolution原理推导和实操
GCA实操和结果呈现

第6天

9.05

周日





[上午]

研讨会及Meta分析

9:00 - 12:00

静息态功能磁共振概述及其在认知与脑疾病的应用前景

脑影像Meta分析介绍

ALE算法原理及操作解读

[下午]

文章撰写的注意事项

14:00 -17:00

磁共振实验设计及数据采集注意事项

数据分析指标在文章中的解释及常见问题

范文解读及文章撰写常见注意事项



备注:请各位学员自带笔记本电脑,建议电脑配置:windows 64位系统、8G以上内存、80G以上剩余硬盘空间。请尽量携带Windows电脑,如果只能使用苹果MAC电脑,请提前使用Bootcmap安装windows 64位系统


4. 授课教师


臧玉峰:医学博士。杭州师范大学心理科学研究院执行院长。1984年于河北医学院获医学学士学位、1991年于天津医学院获神经外科学硕士学位、2002年于北京大学精神卫生研究所获儿童精神卫生博士学位。曾经从事临床神经外科工作14年,之后在中科院自动化所模式识别国家重点实验室、北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室以及杭州师范大学工作。近年来主要从事静息态功能磁共振影像的计算方法学及其在认知与脑疾病的应用研究。与同事提出“局部一致性”和“低频振幅”等方法。带领研究团队开发了REST、DPARSF、RESTplus等软件。合作发表英语论文100多篇,Google Scholar数据库引用21319次(h指数64)。2014到2018年连续5年入选Elsevier“中国高被引学者”(神经科学),2017、2018年入选Clarivate 高被引学者(神经与行为科学)。


吕亚婷:博士,现任杭州师范大学认知与脑疾病研究中心臧玉峰教授课题组担任副研究员,硕士毕业于中国科学院自动化研究所模式识别与智能系统国家重点实验室,2013年博士毕业于德国马克思普朗克人类认知与脑科学研究所。共发表SCI论文21篇。其中,以第一或通讯作者(含共同)在Annals of Neurology、Journal of Neurology、Human Brain Mapping等权威期刊发表SCI论文11篇。申报人研究成果具有较高的临床应用价值,得到了多个项目支持,目前主持1项科技部国家重大慢性非传染性疾病重点研发计划课题,2项国家自然科学基金项目及1项杭州市创业创新项目,共计取得科研经费近200万。目前担任国内神经科学顶级期刊Neuroscience Bulletin(影响因子4.246)的青年编委;Frontiers in Neuroscience的Review Editor;并担任Neuroimage, Neuroimage: Clinical, Science Bulletin, Frontiers系列等国内外刊物的审稿人。


袁丽霞:毕业于浙江大学生物医学工程专业,获工学博士学位,现为杭州师范大学助理研究员。博士前期师从杜一平老师学习磁共振物理、序列设计和数据分析,后期跟随臧玉峰老师学习功能磁共振,探索重复性高的功能磁共振数据分析方法。目前主要的研究方向是基于大样本的数据分析以及多回波功能磁共振数据分析。曾以第一作者发表SCI文章3篇。


贾熙泽:杭州脑海科技有限公司首席执行官,杭州师范大学助理研究员,中国心理学会积极心理学专委会委员,具有计算机、心理学及神经科学交叉背景。目前主持国自然青年基金项目1项,并作为主要参与人参与多项国自然科学基金项目。主要研究方向为静息态功能磁共振方法学、脑影像Meta分析以及静息态数据分析软件开发。2013年起负责维护REST系列工具包,并开发了RESTplus,该软件的论文目前已发表于Science Bulletin (影响因子9.5分)。静息态功能磁共振论坛(http://www.restfmri.net)管理员。合作发表SCI文章21篇,其中主要作者11篇(第一作者或通讯作者)。Neural Plasticity杂志的guest editor,Frontiers in Neuroscience(SCI医学2区,3年平均 IF 3.69)、Frontiers in Psychology(SSCI心理学2区期刊,影响因子2.0)以及Frontiers in Psychiatry(SCI医学3区,3年平均IF 3.18)杂志的评审编辑,Journal of Magnetic Resonance Imaging、Frontiers Aging Neuroscience、Brain research、Scientific Report等多个杂志的审稿人,曾多次受邀在国内外重要学术会议介绍静息态磁共振数据分析。

 

张韬:脑海科技高级数据分析工程师

 

黄国峰:脑海科技高级数据分析工程师


5. 培训说明


培训班限额招生20人,报满截止。我们会按照缴费顺序安排座位,为方便会务安排,报名敬请从速。考虑到疫情原因,本次培训每名学员每天发1个口罩。学员需要提供杭州健康码(支付宝首页搜索‘杭州健康码’)。


6. 培训费用


费用包括培训费、资料费、培训期间提供快餐、饮品以及点心,交通及住宿费用自理,每人3500元。本培训班开具可以报销的正式发票。可以现场刷公务卡,培训期间谢绝录像。可以银行卡转账或支付宝付款,支付宝账号:19941364880,杨会云

7. 培训地点


培训地点:浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼10楼,脑海科技第3会议室。

8. 报名方式


请将报名回执以及缴费回执发送至srbrain@126.com,我们会联系您。

9. 联系方式


电话咨询:黄国峰 180 7298 0399

微信咨询:黄国峰 180 7298 0399


报名回执表

单位名称(发票抬头)


纳税人识别号(税号)


发票类型(会议费/培训费)


姓名


性别


电话号码


微信


科室/专业


研究方向


银行信息

户名:杭州脑海科技有限公司

账号:3301040160015883146

开户行:杭州银行萧山支行

汇款备注

第29期小班

10. 在线支持服务


脑海科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持以及合作服务,确保学员能够熟练掌握脑影像数据处理的相关方法。


获取word版本


1. 扫描二维码

2. 使用百度网盘下载:

链接:https://pan.baidu.com/s/1CMQGofKAZcJ2e3nYWIlhqg

提取码:qa7y


3. 请加微信:180 7298 0399 索取word文档。


多模态基础班

注:基础班每期课程并不完全一样,其中,21期包含PPI技术,22期会详细讲解工作记忆、认知灵活性、干扰控制、抑制控制以及主动控制相关的经典范式,26期包含使用AFNI做激活分析及MVPA技术,27期,及本期的课程包含FNC技术(不包含任务态)

06月01日-06月06日,第21期小班:多模态磁共振数据分析手把手基础班(点击此处查看详情)

06月22日-06月27日,第22期小班:多模态磁共振数据分析手把手基础班(点击此处查看详情)

08月03日-08月08日,第26期小班:多模态磁共振数据分析手把手基础班(点击此处查看详情)


复杂网络专题培训

07月20日-07月25日,第24期小班:复杂网络相关指标理论及实操专题培训(点击此处查看详情)


脑结构数据分析-Freesurfer专题培训

7月27日-8月01日,第25期小班:脑结构数据分析-Freesurfer专题培训(点击此处查看详情)


任务态功能磁共振数据分析专题培训

08月10日-08月15日,第27期小班:任务态功能磁共振数据分析专题培训(点击此处查看详情)


弥散张量成像专题培训,内容涵盖,DTI、DKI、TBSS、确定性追踪、概率性追踪、基于白质纤维的网络构建等:

08月24日-08月29日,第28期小班:弥散张量成像(DTI)指标及纤维追踪专题培训(点击此处查看详情)

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