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脑影像数据分析学习中心报名通知(RS01)

发布:2024-04-13    浏览:76 次


RS01

脑影像数据分析学习中心

报名通知

主办单位

杭州脑海科技有限公司

脑海科技认知神经科学实验室

承办单位

杭州脑呈科技有限公司


















1. 脑海科技脑影像数据分析学习中心介绍


杭州脑海科技有限公司下属的认知神经科学实验室(脑海科技认知神经科学实验室)专注于神经影像相关的学术工作,实验室核心团队组建于2018年,为方便实验室同学体系化的掌握脑影像数据分析技术,实验室于2021年成立了脑影像数据分析学习中心。脑海实验室基于学习中心的模式,目前已累积联合培养硕士研究生41名、博士研究生12名。截止目前,实验室成员累积发表SCI文章85篇,其中JCR一区SCI文章28篇,JCR二区SCI文章41篇

鉴于之前的传统培训班的效果难以达到我们的预期,经过团队慎重的考虑,我们将学习中心内容改进升级后,决定将其对外开放申请,相对于传统的培训模式,有以下优势:

1) 随到随学:学习中心全年开放,可根据自己的时间预约学习

2) 以小组为单位教学:传统培训班模式每期20~30人,老师很难兼顾不同基础的同学,小组答疑通常一个小组为5人左右,以小组为单位教学及答疑,更高的学习效率;

3) 完善的硬件体系:每名学员均配置2台高性能工作站(Intel i7或以上配置),一台用于观看教学视频,另一台用于练习数据分析操作

4) 完善的资料体系:包括体系化的数据分析技术视频、理论课程、学习文档以及完整的案例数据,反复看、重复看、体系化系统的学习

5) 支持一对一教学:如有需要,可提供一对一教学及答疑,定制培养方案和学习体系;

6) 实验室研究团队有着丰富的脑影像研究经验,联合培养了很多优秀的研究生,如:高*艳以主要作者发表SCI文章5篇、郝*奇以主要作者发表SCI文章6篇、李*婷以主要作者发表SCI文章6篇、孙*伟以主要作者发表SCI文章4篇、王*以主要作者发表SCI文章3篇、展*琳以主要作者发表SCI文章3篇等等(鉴于篇幅所限,仅列举部分同学);

7) 学习中心导师及助教团队有着极其丰富的答疑经验:前期我们已经积累大量学术指导经验,目前已有近百余名研究生或医生的联合培养或短期访学的合作经验,截止目前,实验室成员累积发表SCI文章85篇,其中JCR一区SCI文章28篇,JCR二区SCI文章41篇

8) 学习中心核心团队具有丰富的SCI文章审稿经验,担任50余个SCI杂志审稿人,包括:Alzheimer's Research & Therapy、Molecular Autism、IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics、NeuroImage、BMC Psychiatry、Human Brain Mapping、Translational Stroke Research、CNS Neuroscience & Therapeutics、Journal of Affective Disorders、Autism Research等等;

9) 脑海科技团队具有高度交叉背景,背景涵盖:计算机、数学、生物医学工程、心理学、英语、认知神经科学以及临床医学。每名成员均受过体系化科研培训,具有扎实的科研背景并专攻1-2个研究方向。



2. RS01A学习方案介绍


脑影像数据分析学习中心即将推出一系列学习方案,每套学习方案具有唯一编号,大家既可以选择已有学习方案报名,也可以自行提出需求,我们将根据您的实际需求推出新的学习方案体系。我们真诚的希望尽可能灵活的满足大家的需求。


本次推出的学习方案内容见下

项目编号:RS01

适合研究方向:静息态功能磁共振局部指标及功能连接

学习目标:可以较为熟练掌握静息态功能磁共振局部指标及功能连接分析方法,能独立完成相关SCI文章所需的数据分析工作,且理解方法的原理。

//学习方案大纲//



知识点1:静息态功能磁共振入门

通过学习,来访学员将了解研究现代神经影像学技术,尤其是磁共振成像方法的特点与类别,并学习有关的基本术语。如:体素、扫描层、层厚、视场、TR等基本术语,理解层、时间点、时间序列的概念,并掌握医学影像三视图,为后续深入学习奠定基础。同时我们将简介额叶、顶叶、枕叶、颞叶的功能,以及灰质、白质、脑脊液、颅骨、软组织、脑外区域的基本概念。进一步地,我们将详细介绍功能磁共振成像的血氧水平依赖(BOLD)信号原理,以及血液动力响应函数(HRF)的特点。最后,我们将介绍任务态与静息态功能磁共振成像的区别,揭示静息态功能磁共振成像的主要思想。



知识点2:静息态功能磁共振数据整理

来访学员将学会查看与处理DICOM与NIFTI数据,掌握MATLAB基础命令及相关工具箱的使用。我们将了解如何查看扫描信息,包括被试编号、扫描序列、TR、TE、体素大小等。此外,我们将介绍数据结构的软件分析格式与BIDS格式,并介绍使用MRIcro、DICOM Sorter、Dcm2AsiszImg等工具进行数据整理的方法。最后,来访学员将学习DICOM转NIFTI格式的几种不同方式,并学会基于dcm2niigui、RESTplus等工具的格式转换方法。本知识点内容将为来访学员提供基础的数据管理与分析技能,为后续学习打下基础。



知识点3:静息态功能磁共振文献解读

通过对经典静息态文献的解读,来访学员将了解自发活动、任务态与静息态的差异、低频波动、静息态功能连接、静息态功能网络等重要概念。我们还将介绍文献检索的方法,包括检索目的、策略与常用检索网站,使来访学员能够有效获取相关领域的最新信息。



知识点4:静息态功能磁共振预处理

这一阶段,来访学员将深入学习RESTplus工具箱的使用,完成静息态数据预处理的有关操作。我们将详细介绍去除时间点、时间层校正、头动校正、空间标准化、平滑、去线性趋势、回归协变量、滤波等预处理步骤的原理、注意事项和操作方法。最终,来访学员将掌握RESTplus预处理操作的整体流程,学会结果文件解读,并了解被试质控的方法。



知识点5:局部指标ALFF

来访学员将深入学习低频振幅(ALFF)的有关内容,包括功率谱与ALFF的计算方法、提出文献、应用研究示例以及实操过程。我们还将介绍相关指标如fALFF、PerAF、Wavelet-ALFF的计算原理、提出文献、操作方法,同时讨论各指标的预处理步骤注意事项、指标计算参数设置以及结果标准化方法。



知识点6:局部指标ReHo

来访学员将学习邻域的基本概念,学习面连接、边连接、角连接判断方式。而后了解肯德尔和谐系数与频域相干性的计算公式,并掌握肯德尔和谐系数-局部一致性(KCC-ReHo)和频域相干性-局部一致性(Cohe-ReHo)的计算原理和实际操作过程。同样地,会为其介绍指标的预处理步骤注意事项、指标计算参数设置和结果标准化方法。



知识点7:局部指标DC

来访学员将首先学习节点度与度中心性(DC)的概念与含义,探讨二值化DC与加权DC的区别。并理解DC的计算原理、相关文献和实际操作过程。最终我们会讨论指标的预处理步骤注意事项、指标计算参数设置和结果标准化等有关内容。



知识点8:功能连接FC

来访学员将深入研究功能连接的核心概念和计算方式。首先,我们会介绍皮尔逊相关系数,使大家了解如何使用皮尔逊相关系数来描述不同脑区之间的相关性。进一步,我们将介绍种子点的概念,来访学员将学会基于种子点进行功能连接分析(voxel-wise FC)。我们也将介绍感兴趣区域(ROI),以及连接矩阵的概念,来访学员将学会多个ROI之间的功能连接分析(ROI-wise FC)。该系列内容将使来访学员全面掌握功能连接分析的理论基础和实践操作技能,为研究大脑功能网络提供坚实基础。



知识点9:NIFTI数据的统计与校正

来访学员将了解假设检验的基本流程,以及抽样分布、单尾、双尾等基本统计学概念。我们将聚焦在NIFTI数据上,介绍单样本T检验、双样本T检验、配对样本T检验、方差分析的基本概念、假设、计算公式,以及在RESTplus中的实际操作方法。进一步地,来访学员将了解进行多重比较校正的必要性,理解FDR和GRF等校正方法,同时我们将探讨Voxel-level与Cluster-level校正水平,为来访学员提供对不同校正方法的全面认识。最后,我们将演示基于RESTplus进行统计、多重比较校正与结果保存的实际操作方法。使来访学员具备基于NIFTI数据进行统计分析的理论和实践技能。



知识点10:脑区信号与行为学数据的相关性分析

我们将探索脑区信号与行为学数据的相关性分析方法,帮助来访学员理解大脑功能与行为的关系。首先,我们将介绍RESTplus提取脑区信号的方法,并演示基于统计结果显著的脑区提取脑区信号的过程,使来访学员能够根据研究需求精确提取有关脑区的信号。其后我们将介绍SPSS软件,来访学员将学会如何进行相关性分析,包括数据录入、分析操作和结果解读。我们还将讨论协变量的设置与偏相关分析,以更全面地探索脑区信号与行为学数据之间的关联。



知识点11:作图

作图部分将详细介绍三种常用作图工具的详细操作方法,帮助大家提升数据可视化水平,使研究结果更具表现力。

RSETplus作图:来访学员将学会RSETplus的底板设置、overlay设置,三视图选择,以及层图显示行列设置。我们将演示如何修改颜色条,有效地呈现数据,并最终保存图片的方法。

BrainNet作图:我们将介绍不同皮层模版。



3. 脑海科技相关介绍


脑海科技设立于萧山区紫橙国际创新中心3号楼10层,是一家专注于脑影像相关的科研平台研发、技术培训、数据分析技术服务及脑科学相关设备销售的科技型公司,已被认定为“国家级高新技术企业”、“国家级科技型中小企业”及“浙江省科技型中小企业”,入选杭州市萧山区高层次人才创业创新“5213”领航类项目,并经杭州市科协审批建立了“博士创新站”。 

贾熙泽,杭州脑海科技首席执行官,现任山东第二医科大学附属医院特聘专家、常熟市第二人民医院磁共振脑成像研究中心副主任、特聘研究员、兼任杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心副研究员、大连市友谊医院特聘教授、山东第二医科大学医学影像学院硕士生导师、佳木斯大学信息电子技术学院硕士生导师、中国心理学会积极心理学专委会委员、浙江省数理医学学会放射学专委会委员、浙江省康复医学会神经调控专委会委员及杭州市萧山区青年科技工作者协会会员。主持国自然青年基金项目、浙江省智能教育技术与应用重点实验室开放研究基金重点项目,入选杭州市青年科技人才培育工程项目,作为主要参与人参与 8 项国自然科学基金项目、 1 项科技部国家重大慢性非传染性疾病重点研发计划课题。目前合作发表 SCI 论文 30 余篇,以主要作者在 Science Bulletin、 Human Brain Mapping、 The Journal of Headache and Pain 及 Journal of Affective Disorders 等杂志发表文章 30 余篇(第一作者或通讯作者),文章被 SCI 杂志引用近866次,h-index =16,担任 40余个SCI杂志的审稿人。



4. 费用范例及相关说明


根据我们的前期实战,学习中心模式相对于传统培训班模式效果更好。传统的培训班通常在6天内集中式教学短时间内讲授大量知识点,根据已有经验而言,由于学员基础不同、背景不同,效果很难达到预期。另一种方法是线上课程,该方式价格也要数千元,但也存在学习效果达不到预期以及答疑不方便等问题。

经过脑海科技核心团队反复沟通及研究,决定在同等的价格下,提供更优质的服务。

目前,脑海科技学习中心,推出性价比较高的RS01A2学习优惠方案,只需要3480元,即可涵盖以下内容:

1)时间充足。可在学习中心学习一周(7天);

2)高性能硬件。为每名学员配置两台i7以上的工作站,不需要自带电脑,高性能的硬件,让学习效率更高;

3)体系化学习。两台工作站,其中一台用于观看体系化的学习视频及资料,另一台用于数据分析演练,体系化的学习视频可供反复观看,效率更高;

4)面对面小组答疑。现场以小组的方式进行答疑,每组为5人左右。面对面答疑效率更高,控制人数效果更好;

另外,对于有更高需求的学员,还可以支持一对一答疑等方式,欢迎咨询。



5. 报名流程及付款方式


(1)随到随学,预约制报名。考虑到实验室承载能力有限,采用预约制,目前实验室对外开放10个学习名额

(2)报名流程。报名可先扫描以下二维码添加李雪微信(扫描以下二维码或添加微信号:19157850159),我们将与您电话沟通学习需求及目标,并出具学习计划及对应报价单。完成付款后,即可开始预约学习,随到随学。

(3)关于发票。可开具能够报销的正式发票(如:技术服务费及培训费等)。支持预存,可以现场刷公务卡或银行卡转账,学习期间谢绝录像及录音。

电话咨询:0571-2883 4398(请按3号键)

微信咨询:191 5785 0159

邮箱咨询:lixue@fmri123.com

实验室地址:浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼6楼602室



6. 更多学习方案敬请期待


后续会开放更多学习方案,研究方向包括不限于:基于图论的复杂网络、基于脑影像的Meta分析、弥散张量成像(DTI、扩散峰度成像(DKI)、定量磁化率成像(QSM)、独立成分分析(ICA)、格兰杰因果分析(GCA)、基于白质功能信号的网络分析、动态因果模型(DCM)、机器学习、深度学习(如生成对抗网络、强化学习等)、功能磁共振任务态数据分析等等。有其他想要学习的内容,欢迎添加微信反馈(微信号:19157850159),我们将研发新的学习方案。







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