数据导入
西门子、飞利浦、联影、GE…发布:2024-07-10 浏览:346 次
主办单位
杭州脑海科技有限公司
脑海科技认知神经科学实验室
承办单位
杭州脑呈科技有限公司
1. 脑海科技脑影像数据分析学习中心介绍
杭州脑海科技有限公司下属的认知神经科学实验室(脑海科技认知神经科学实验室)专注于神经影像相关的学术工作,实验室核心团队组建于2018年,为方便实验室同学体系化的掌握脑影像数据分析技术,实验室于2021年成立了脑影像数据分析学习中心。脑海实验室基于学习中心的模式,目前已累积联合培养硕士研究生41名、博士研究生12名。截止目前,实验室成员累积发表SCI文章85篇,其中JCR一区SCI文章28篇,JCR二区SCI文章41篇。
2. RS02A训练营介绍
//训练营日程规划//
(每名学员有专属导师定期跟进学习进展,协助调整学习计划)
时间范围 | 主题 | 学习目标 | 课后作业与学习效果评估 |
第1天 上午 | 静息态入门与预处理 |
| 独立查看案例数据的扫描参数 |
第1天 下午 |
| 独立操作案例数据的预处理 | |
第1天 晚上 |
| 完成案例数据的数据整理 | |
第2天 上午 | 局部指标计算(ALFFALFFPerAFWavelet-ALFF) |
| 完成案例数据的ALFF计算 完成案例数据的PerAF计算 完成案例数据的fALFF计算 完成案例数据的wavelet-ALFF计算 |
第2天 | 局部指标计算(ReHo) |
| 完成案例数据的KCC-ReHo计算 完成案例数据的Cohe-ReHo计算 独立讲解局部一致性的计算原理 |
第2天 | 盲反卷积与GCA |
| 案例数据的处理与知识点回顾 |
第3天 | 局部指标计算(DC) |
| 完成案例数据的DC指标计算 |
第3天 | 功能连接计算(FC)与GCA实操练习 |
| 完成案例数据的种子点功能连接指标计算 独立制作种子点文件(小球、制作mask文件、从图谱中提取分区作为种子点) |
第3天 | 复习 |
| 完成案例数据的ROI水平的功能连接指标计算 |
第4天 | MATLAB代码学习 |
| 独立撰写for循环批量读写被试的NIFTI数据 根据案例数据的格式和RESTplus的文件夹要求进行批量文件夹结构修改 |
第4天 |
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第4天 |
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第5天 | 统计分析与结果汇报 |
| 完成案例数据的双样本T检验分析+TFCE校正 完成案例数据的单样本T检验分析+GRF校正 |
第5天 |
| 完成案例数据的差异结果汇报,制作三线表、Montage图、皮层图,使用PS进行图片的美化 | |
第5天 |
| 文献阅读,针对文献中的分析步骤进行结果的复现 | |
第6天 | 实战练习 |
| 在复现过程中进行查缺补漏,对课程进行回顾。这种方式强调了通过动手操作来检验和巩固理论知识,识别并弥补学习过程中的知识盲点,确保全面掌握课程要点。 |
第6天 |
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第6天 |
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本期训练营涵盖的课程视频资源
课
程
导
航
RS02-1:静息态数据分析-主讲老师 迟若枫
RS02-2:静息态数据分析-主讲老师 赵梦琦
RS02-3:静息态数据分析-主讲老师 王晴
RS02-4:静息态数据分析-主讲老师 曹倚康
RS02-5:静息态数据分析-主讲老师 王凡
RS02-6:静息态数据分析-主讲老师 王凡
RS02-7:静息态数据分析-主讲老师 李梦婷
RS02-8:格兰杰因果分析-主讲老师 孙家伟
RS02-9:格兰杰因果分析-主讲老师 郝泽奇
RS02-10:结果汇报与展示 主讲老师 孙家伟
RS02-1:静息态数据分析-主讲老师 迟若枫
课程编号:RS02-1 | |||
主讲老师 | 课程名称 | 具体内容 | 课时数 |
迟若枫 | 01 静息态功能磁共振入门 | 磁共振成像基础概念 | 1课时 |
大脑解剖学基础概念 | |||
功能磁共振成像与BOLD信号原理 | |||
静息态功能磁共振脑成像 | |||
02 静息态功能磁共振数据整理 | 脑成像数据格式介绍 | 2课时 | |
脑成像工具箱与软件的简介与安装 | |||
数据信息查看 | |||
数据整理 | |||
数据格式转换 | |||
03 静息态功能磁共振文献解读 | 经典文献解读 | 0.5课时 | |
文献检索方法 | |||
04 静息态预处理 | RESTplus工具箱简介 | 2课时 | |
数据预处理步骤 | |||
RESTplus预处理操作 | |||
05 静息态指标ALFF | 静息态ALFF算法讲解与实操 | 1课时 | |
静息态fALFF算法讲解与实操 | |||
静息态PerAF算法讲解与实操 | |||
静息态Wavelet-ALFF算法讲解与实操 | |||
06 静息态指标ReHo | 静息态KCC-ReHo算法讲解与实操 | 0.5课时 | |
静息态Cohe-ReHo算法讲解与实操 | |||
07 静息态指标DC | 静息态DC算法讲解与实操 | 0.5课时 | |
08静息态指标FC | 功能连接(FC)算法概述 | 1课时 | |
基于体素的功能连接算法讲解与实操 | |||
基于感兴趣区的功能连接算法讲解与实操 | |||
09 NIFTI数据的统计与校正 | 基于NIFTI数据的单样本T检验 | 2.5课时 | |
基于NIFTI数据的双样本T检验 | |||
基于NIFTI数据的配对样本T检验 | |||
基于NIFTI数据的方差分析 | |||
多重比较校正 | |||
统计结果RESTplus作图与汇报 | |||
10 脑区信号与行为学数据的相关性分析 | NIFTI图像信号提取 | 1课时 | |
脑区信号与量表分数的相关分析 | |||
脑区信号与量表分数的偏相关分析 | |||
11 作图 | RESTplus作图:视图设置、Montage设置、colorbar设置、保存图像 | 2课时 | |
Brainnet作图:map图、球棍图 | |||
SPSS作图:条形图、折线图、散点图 | |||
12 人口学资料统计 | 人口学资料统计表格简介 | 1课时 | |
人口学资料统计——连续变量 | |||
人口学资料统计——离散变量 | |||
13 三线表 | 脑区结果三线表 | 1课时 | |
人口学资料统计结果三线表 | |||
其他统计结果三线表 | |||
14 数据分析常用小工具 | NIFTI图像重采样 | 1课时 | |
NIFTI图像数学运算 | |||
NIFTI图像信号提取 |
RS02-2:静息态数据分析-主讲老师 赵梦琦
课程编号:RS02-2 | |||
主讲老师 | 课程名称 | 具体内容 | 课时数 |
赵梦琦 | 01 静息态功能磁共振入门 | 功能磁共振成像简介 | 0.5课时 |
静息态功能磁共振成像简介 | |||
静息态功能磁共振成像基础概念与术语 | |||
02 静息态功能磁共振文献解读 | 文献解读 | 1课时 | |
文献检索方法 | |||
03 静息态功能磁共振数据整理 | 脑成像数据格式介绍 | 2课时 | |
DICOM数据信息查看 | |||
DICOM数据文件整理 | |||
数据格式转换 | |||
04 静息态预处理 | 去除时间点的原理与操作 | 2.5课时 | |
时间层校正的原理与操作 | |||
头动校正的原理与操作 | |||
标准化的原理与操作 | |||
平滑的原理与操作 | |||
去线性趋势的原理与操作 | |||
回归协变量的原理与操作 | |||
滤波的原理与操作 | |||
05 静息态局部指标ALFF、ReHo、DC | 静息态ALFF算法讲解与实操 | 1.5课时 | |
静息态fALFF算法讲解与实操 | |||
静息态PerAF算法讲解与实操 | |||
静息态ReHo算法讲解与实操 | |||
静息态DC算法讲解与实操 | |||
06 静息态指标FC | 功能连接(FC)算法概述 | 1课时 | |
基于体素的功能连接算法讲解与实操 | |||
基于感兴趣区的功能连接算法讲解与实操 | |||
07 NIFTI数据的统计与校正 | 基于NIFTI数据的单样本T检验 | 2课时 | |
基于NIFTI数据的双样本T检验 | |||
基于NIFTI数据的配对样本T检验 | |||
多重比较校正 | |||
08 数据分析常用小工具 | mask制作 | 2课时 | |
NIFTI图像重采样 | |||
NIFTI图像数学运算 | |||
NIFTI图像信号提取 | |||
09 作图作表 | 结果三线表 | 1.5课时 | |
RESTplus脑区结果图制作 | |||
Brainnet作图:map图、球棍图 |
RS02-3:静息态数据分析-主讲老师 王晴
课程编号:RS02-3 | |||
主讲老师 | 课程名称 | 具体内容 | 课时数 |
王晴 | 静息态fMRI基础知识 | 静息态功能磁共振成像简介 | 1.5课时 |
静息态功能磁共振成像优势 | |||
静息态功能磁共振成像基础概念与常用术语 | |||
数据转换与整理 | DICOM数据格式介绍 | 4课时 | |
DICOM数据信息查看 | |||
数据整理方法介绍与操作(MRIcro、DICOM Sorter、Dcm2AsiszImg) | |||
预处理原理讲解与操作 | 预处理分步骤讲解与实操 | 3.5课时 | |
各步骤结果文件说明 | |||
静息态局部指标与功能连接 | 静息态振幅指标讲解与实操 | 4课时 | |
静息态局部一致性指标讲解与实操 | |||
功能连接指标讲解与实操 | |||
统计分析操作、多重比较校正 | 基于RESTplus的统计分析讲解与实操 | 1课时 | |
基于RESTplus的多重比较校正(GRF与FDR) | |||
脑影像小工具的使用 | 三维图像计算 | 3课时 | |
图像重采样 | |||
区域信号提取 | |||
图表制作 | RESTplus viewer作图讲解 | 2课时 | |
BrainNet作图 | |||
初步使用PS拼接图片 | |||
MATLAB基础编程讲解 | mask制作与信号提取 | 13课时 | |
功能连接与低频振幅代码讲解 | |||
局部一致性代码讲解 | |||
静息态文献检索 | SCI文献介绍 | 1课时 | |
文献检索网络推荐与文献导读 | |||
文献检索注意事项 |
RS02-4:静息态数据分析-主讲老师 曹倚康
课程编号:RS02-4 | |||
主讲老师 | 课程名称 | 具体内容 | 课时数 |
曹倚康 | 静息态fMRI数据整理 | 静息态功能磁共振基本概念 | 5课时 |
静息态数据整理演示 | |||
静息态数据预处理 | 基于RESTplus的预处理讲解 | ||
基于RESTplus的预处理实操 | |||
静息态指标计算 | 静息态低频振幅的计算 | ||
静息态局部一致性计算 | |||
静息态度中心性计算 | |||
静息态功能连接计算 | |||
统计分析与结果呈现 | 统计分析讲解 | ||
多重比较校正讲解与实操 | |||
结果呈现注意事项 |
RS02-5:静息态数据分析-主讲老师 王凡
课程编号:RS02-5 | |||
主讲老师 | 课程名称 | 具体内容 | 课时数 |
王凡 | fMRI概念与数据整理 | 功能磁共振成像原理简介 | 2课时 |
功能磁共振成像基础术语介绍 | |||
fMRI数据整理 | |||
基于RESTplus的数据预处理 | 数据预处理分步骤讲解 | 1.5课时 | |
预处理注意事项 | |||
指标计算 | 静息态局部指标介绍 | 1.5课时 | |
静息态功能连接指标介绍 | |||
统计分析及多重比较校正 | 统计分析实操 | 2课时 | |
多重比较校正讲解 |
RS02-6:静息态数据分析-主讲老师 王凡
课程编号:RS02-6 | |||
主讲老师 | 课程名称 | 具体内容 | 课时数 |
王凡 | 静息态功能磁共振入门 | fMRI基础概念介绍 | 4.5课时 |
原始数据整理 | |||
原始数据格式转换讲解 | |||
数据预处理 | 预处理方法与常用预处理流程 | 1.5课时 | |
静息态数据的预处理实操 | |||
指标计算讲解 | 静息态局部指标讲解与实操 | 2课时 | |
静息态功能连接讲解与实操 | |||
结果呈现与小工具的使用 | 组间差异结果汇报 | 2课时 | |
脑影像常用小工具讲解 |
RS02-7:静息态数据分析-主讲老师 李梦婷
课程编号:RS02-7 | |||
主讲老师 | 课程名称 | 具体内容 | 课时数 |
李梦婷 | 静息态数据预处理 | 静息态数据分析流程 | 3.5课时 |
数据整理结构说明 | |||
数据预处理步骤详解及审稿意见回复思路 | |||
静息态指标计算 | 静息态常用指标意义讲解 | ||
解释结果的注意事项 | |||
统计分析 | 统计分析与TFCE校正的讲解 | ||
统计分析与TFCE校正操作演示 |
RS02-8:格兰杰因果分析-主讲老师 孙家伟
课程编号:RS02-8 | |||
主讲老师 | 课程名称 | 具体内容 | 课时数 |
孙家伟 | 盲反卷积和GCA | 盲反卷积原理 rsHRF工具包介绍 盲反卷积实操 GCA原理讲解 | 3课时 |
RS02-9:格兰杰因果分析-主讲老师 郝泽奇
课程编号:RS02-9 | |||
主讲老师 | 课程名称 | 具体内容 | 课时数 |
郝泽奇 | GCA文献导读与文章撰写注意事项 | GCA文献讲解 GCA文章写作注意事项 | 2课时 |
RS02-10:结果汇报与展示 主讲老师 孙家伟
课程编号:RS02-10 | |||
主讲老师 | 课程名称 | 具体内容 | 课时数 |
孙家伟 | 静息态磁共振基础课程 | 结果汇报讲解及注意事项 | 2课时 |
3. 脑海科技相关介绍
脑海科技设立于萧山区紫橙国际创新中心3号楼10层,是一家专注于脑影像相关的科研平台研发、技术培训、数据分析技术服务及脑科学相关设备销售的科技型公司,已被认定为“国家级高新技术企业”、“国家级科技型中小企业”、“浙江省创新型中小企业”及“浙江省科技型中小企业”,入选杭州市萧山区高层次人才创业创新“5213”领航类项目,并经杭州市科协审批建立了“博士创新站”。
4. RS02A训练营报名费用及相关说明
根据我们的前期实战,学习中心模式相对于传统培训班模式效果更好。传统的培训班通常在6天内集中式现场短时间内讲授大量知识点,学员很容易跟不上。另一种方法是线上课程,该方式价格也要数千元,根据已有经验而言,由于学员基础不同、背景不同,效果很难达到预期,并且也存答疑不方便等问题。
5. 报名流程及付款方式
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