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脑海科技——基于啮齿类动物的神经影像数据分析平台
Based on Rodent Animal Neural Image Data Analysis Platform
传统动物脑影像(尤其是小动物MRI)数据缺乏针对性的标准化预处理与分析流程,动物影像分辨率高但噪声大,处理失败率高,同时缺乏标准化模板导致跨实验室结果不可比。
脑海科技专门针对啮齿类动物(大小鼠)的脑影像数据特点,开发了从预处理、标准化到多种指标分析的全套工具。它帮助研究人员快速、准确地从动物模型数据中提取可靠指标,搭建起连接基础研究与临床应用的桥梁。
产品特色
Product Features
大小鼠数据预处理
包括数据格式转换、小鼠方位调整、图像放缩、去除时间点、时间层校正、头动校正、空间标准化、空间平滑
大小鼠数据指标计算与组水平统计
低频振幅指标分析(ALFF、fALFF、Wavelet ALFF、PerAF)、局部一致性分析(KCC-ReHo、Cohe-ReHo)、度中心性分析(Binary-DC、Weighted-DC)、基于体素的形态学分析、基于白质骨架的统计分析
基于体素的形态学分析
在体素级别定量评估局部灰质体积(GMV)的差异,可以一键式针对大鼠/小鼠的结构像功能磁共振序列进行体素缩放、脑提取、配准、分割、空间标准化、脑区模块化、平滑等处理,生成灰质体积指标
基于白质骨架的统计分析
该方法可基于白质骨架进行白质微观指标的体素级组间比较。可以一键式对大鼠/小鼠进行Mask创建,白质骨架创建,基于白质骨架的统计分析,结果膨胀等
小鼠功能连接梯度
小鼠功能连接梯度分析与人类研究类似,都是通过基于皮尔逊相关构建全脑功能连接矩阵,再运用扩散图嵌入等降维技术提取主要梯度成分
参考文献
常见算法引用参考文献资料
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